More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0948 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 179 aa  354  3.9999999999999996e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  97.21 
 
 		 179 aa  347  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 		 179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  73.18 
 
 		 179 aa  268  4e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  69.83 
 
 		 179 aa  262  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  69.83 
 
 		 179 aa  247  7e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  65.36 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  59.22 
 
 		 179 aa  209  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  60.67 
 
 		 180 aa  204  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 179 aa  201  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2033  50S ribosomal protein L6  56.74 
 
 		 180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.693671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1948  50S ribosomal protein L6  56.74 
 
 		 180 aa  196  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1931  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 180 aa  193  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 178 aa  191  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 178 aa  190  9e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 178 aa  189  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  55 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  55 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  54.7 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  55.62 
 
 		 177 aa  187  5.999999999999999e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  187  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  53.63 
 
 		 179 aa  187  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 		 179 aa  187  8e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 178 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  54.39 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  54.39 
 
 		 182 aa  186  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 182 aa  185  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  184  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  51.12 
 
 		 178 aa  184  4e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  52.81 
 
 		 178 aa  185  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  52.57 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  184  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  184  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  184  8e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 180 aa  181  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  51.4 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  53.51 
 
 		 187 aa  181  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  181  7e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  54.44 
 
 		 180 aa  180  8.000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2050  ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 178 aa  179  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.0184636 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 180 aa  180  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 180 aa  180  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  51.4 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  53.07 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1860  50S ribosomal protein L6  51.61 
 
 		 178 aa  177  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1689  50S ribosomal protein L6  51.61 
 
 		 178 aa  177  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.267616  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 180 aa  177  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2066  50S ribosomal protein L6  51.61 
 
 		 178 aa  177  8e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  177  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>