More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0862 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  100 
 
 		 177 aa  357  4e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  58.29 
 
 		 180 aa  204  4e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  201  3e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  56 
 
 		 181 aa  194  4.0000000000000005e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  192  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  53.71 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  54.39 
 
 		 182 aa  191  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  191  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  56.57 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0049  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 178 aa  190  8e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.560841  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  190  9e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1860  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 178 aa  189  1e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  190  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2066  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 178 aa  189  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  189  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1689  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 178 aa  189  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.267616  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  189  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4529  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000152303  hitchhiker  0.000162155 
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  188  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0298  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  187  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000138851  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3899  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  187  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139368  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0598  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  187  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000013887  normal  0.735029 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  187  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03156  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000273178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0408  ribosomal protein L6 signature 1  52.78 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001181  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3694  50S ribosomal protein L6  53.59 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0880192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3690  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000170909  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4628  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000296835  normal  0.936677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3788  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000156973  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3600  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00731053  normal  0.0167726 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0420  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00669543  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03107  hypothetical protein  52.78 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000133235  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3729  50S ribosomal protein L6  53.59 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0348679 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3621  50S ribosomal protein L6  53.59 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000291027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0408  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000304254  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3499  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000406274  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3621  50S ribosomal protein L6  53.59 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0403056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0074  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1931  50S ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 177 aa  185  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1761  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00139046  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 180 aa  185  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3792  50S ribosomal protein L6  53.04 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 179 aa  184  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  53.71 
 
 		 178 aa  184  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00745  50S ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1146  ribosomal protein L6  57.14 
 
 		 178 aa  184  5e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000104709  hitchhiker  0.00466337 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  184  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  53.22 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001727  LSU ribosomal protein L6p (L9e)  51.67 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000194026  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1004  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00326754  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1018  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000674747  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3807  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2159  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1953  ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 178 aa  182  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0099  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.492804  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  181  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 179 aa  181  7e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 180 aa  181  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3986  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0087686  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0335  50S ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000240759  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>