More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0606 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 177 aa  358  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  82.49 
 
 		 177 aa  305  3e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  79.1 
 
 		 177 aa  298  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  79.66 
 
 		 177 aa  291  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  79.1 
 
 		 177 aa  290  7e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  79.1 
 
 		 177 aa  290  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  74.58 
 
 		 177 aa  283  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  63.84 
 
 		 177 aa  241  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  63.28 
 
 		 177 aa  231  6e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  63.28 
 
 		 177 aa  229  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  228  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 177 aa  227  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  226  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0338  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  226  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  226  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  226  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  225  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  225  3e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 177 aa  224  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 177 aa  223  9e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 177 aa  223  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  60.45 
 
 		 177 aa  223  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 177 aa  221  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  60.45 
 
 		 177 aa  221  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  221  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  221  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2203  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0750089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0713  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  216  8.999999999999998e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0735747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1445  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1347  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000134886  normal  0.277418 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  59.89 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  204  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  201  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  194  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 180 aa  191  7e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0075  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0536854  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0441  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296356  hitchhiker  0.000109216 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  48.02 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 176 aa  184  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 176 aa  184  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  50 
 
 		 178 aa  184  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0974  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234587  hitchhiker  0.00000109608 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 179 aa  184  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0782  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  184  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000462697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  183  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2159  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0338  ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 175 aa  181  4.0000000000000006e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0436  50S ribosomal protein L6P  50.85 
 
 		 176 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0157307  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0504  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00191336  hitchhiker  0.0041563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0334  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 176 aa  181  6e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000427572  unclonable  0.0000000488908 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2981  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 179 aa  180  9.000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0499  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 177 aa  180  9.000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000112242  normal  0.0683389 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00745  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 179 aa  179  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0335  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000240759  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0074  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  48 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4529  50S ribosomal protein L6  45.76 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000152303  hitchhiker  0.000162155 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3807  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001727  LSU ribosomal protein L6p (L9e)  48.02 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000194026  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00953  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0734749  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0099  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 178 aa  177  4.999999999999999e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.492804  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0681  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 180 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 179 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  177  7e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0294  50S ribosomal protein L6P  48.02 
 
 		 177 aa  177  7e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000550047  hitchhiker  0.00000213592 
 
 
 
NC_009092  Shew_0173  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 176 aa  177  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111848  decreased coverage  0.0000538106 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  50 
 
 		 181 aa  177  8e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0509  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 175 aa  177  8e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.910827  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3509  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  177  9e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000396017  hitchhiker  0.00000010719 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0420  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 176 aa  176  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146795  normal  0.235995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>