More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0304 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 179 aa  359  9e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  87.15 
 
 		 179 aa  324  4.0000000000000003e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  84.92 
 
 		 179 aa  314  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  83.24 
 
 		 179 aa  308  2.9999999999999997e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  77.09 
 
 		 179 aa  287  7e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  73.18 
 
 		 180 aa  276  1e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  73.74 
 
 		 179 aa  270  9e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  52.54 
 
 		 181 aa  188  5e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 180 aa  187  9e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 178 aa  186  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  51.09 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 181 aa  185  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  181  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3147  50S ribosomal protein L6  51.09 
 
 		 184 aa  181  7e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042273  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0617  ribosomal protein L6  51.09 
 
 		 185 aa  179  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 182 aa  179  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  50.85 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_002950  PG1923  50S ribosomal protein L6  48.09 
 
 		 183 aa  177  7e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  47.75 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  177  9e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  177  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  177  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  50.88 
 
 		 182 aa  175  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 177 aa  175  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5772  ribosomal protein L6  50 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245176  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 178 aa  174  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 180 aa  174  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 178 aa  174  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  48.54 
 
 		 182 aa  174  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0182  50S ribosomal protein L6  51.09 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1630  ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  49.15 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  48.02 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 178 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3053  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 176 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000512294  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  48.02 
 
 		 178 aa  171  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  47.22 
 
 		 181 aa  171  5e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0065  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654167  hitchhiker  0.0000000000000139653 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  48.02 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  47.46 
 
 		 179 aa  171  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  48.92 
 
 		 187 aa  169  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  46.37 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0068  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00100116  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 178 aa  170  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  46.07 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0382  50S ribosomal protein L6  51.38 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  44.69 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  45.86 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4358  ribosomal protein L6  50 
 
 		 185 aa  169  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000653626  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  47.22 
 
 		 180 aa  169  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1146  ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 178 aa  169  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000104709  hitchhiker  0.00466337 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 176 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0329  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 176 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00323508  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  47.83 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  47.83 
 
 		 184 aa  169  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  47.75 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  48.31 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2617  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 176 aa  168  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00663642  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3731  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 176 aa  168  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000218121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3789  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 176 aa  168  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1939  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 176 aa  168  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0207492  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  46.07 
 
 		 179 aa  168  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>