More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1931 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1931  50S ribosomal protein L6  100 
 
 
180 aa  354  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2033  50S ribosomal protein L6  98.33 
 
 
180 aa  348  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.693671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1948  50S ribosomal protein L6  97.78 
 
 
180 aa  348  3e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  86.11 
 
 
180 aa  310  9e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 
179 aa  206  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 
179 aa  201  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 
179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 
179 aa  193  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 
179 aa  192  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 
179 aa  191  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 
179 aa  187  5e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 
179 aa  186  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 
179 aa  185  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  51.12 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  46.89 
 
 
181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  48.31 
 
 
178 aa  181  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1241  50S ribosomal protein L6  50.55 
 
 
179 aa  179  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138167  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  48.6 
 
 
179 aa  179  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 
179 aa  179  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  46.07 
 
 
177 aa  178  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 
177 aa  178  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  50 
 
 
179 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  47.19 
 
 
180 aa  176  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2050  ribosomal protein L6  48.02 
 
 
178 aa  176  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.0184636 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 
179 aa  175  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 
177 aa  176  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  49.16 
 
 
179 aa  175  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  48.6 
 
 
179 aa  175  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 
177 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  51.67 
 
 
181 aa  174  6e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 
178 aa  174  8e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 
177 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 
179 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  46.63 
 
 
178 aa  173  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  45.81 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  46.07 
 
 
178 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  46.37 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 
180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 
180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 
177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  45.25 
 
 
179 aa  171  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 
177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 
177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  46.59 
 
 
177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  46.59 
 
 
177 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0211  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 
178 aa  171  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  46.59 
 
 
177 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 
177 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  47.49 
 
 
179 aa  171  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  46.59 
 
 
177 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  46.59 
 
 
177 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  48.02 
 
 
177 aa  170  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  50.83 
 
 
179 aa  171  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 
179 aa  170  7.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  48.31 
 
 
179 aa  170  9e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 
178 aa  170  9e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 
177 aa  170  9e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  50 
 
 
177 aa  170  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  46.59 
 
 
177 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  50 
 
 
177 aa  170  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 
177 aa  169  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 
177 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  47.49 
 
 
179 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  44.69 
 
 
179 aa  169  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 
179 aa  168  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  47.19 
 
 
179 aa  168  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 
177 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  46.07 
 
 
178 aa  168  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 
177 aa  168  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  46.07 
 
 
178 aa  168  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 
180 aa  167  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  46.37 
 
 
179 aa  167  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  46.02 
 
 
177 aa  167  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  46.93 
 
 
179 aa  167  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  43.58 
 
 
179 aa  167  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 
178 aa  167  9e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  46.55 
 
 
182 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2892  ribosomal protein L6  47.75 
 
 
180 aa  166  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0436  50S ribosomal protein L6P  47.73 
 
 
176 aa  166  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0157307  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0723  50S ribosomal protein L6  45.2 
 
 
176 aa  166  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0843452  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  47.49 
 
 
179 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  45.51 
 
 
178 aa  166  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  46.37 
 
 
179 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  44.38 
 
 
178 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  46.37 
 
 
179 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  46.37 
 
 
179 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 
177 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 
177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  47.75 
 
 
178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 
177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  48.04 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1306  50S ribosomal protein L6  44.97 
 
 
191 aa  164  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629713  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 
179 aa  165  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  44.13 
 
 
179 aa  165  4e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  46.07 
 
 
177 aa  164  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  50 
 
 
179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  45.51 
 
 
178 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  45.56 
 
 
181 aa  164  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>