More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0209 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  100 
 
 
178 aa  351  2e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  61.58 
 
 
179 aa  231  6e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  63.95 
 
 
182 aa  229  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  62.36 
 
 
180 aa  228  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  62.36 
 
 
178 aa  225  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  61.24 
 
 
178 aa  224  6e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  62.87 
 
 
182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  57.06 
 
 
177 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  60.8 
 
 
182 aa  214  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  59.22 
 
 
179 aa  213  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  59.78 
 
 
179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  57.3 
 
 
179 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  58.66 
 
 
179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  58.66 
 
 
179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  58.66 
 
 
179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  58.66 
 
 
179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  58.66 
 
 
179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  58.66 
 
 
179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  58.66 
 
 
179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  58.66 
 
 
179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  59.43 
 
 
177 aa  211  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  58.43 
 
 
179 aa  209  1e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  61.4 
 
 
183 aa  210  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  59.22 
 
 
179 aa  209  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 
178 aa  208  3e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  58.66 
 
 
179 aa  208  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 
187 aa  207  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 
179 aa  207  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 
179 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 
179 aa  205  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 
179 aa  205  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 
179 aa  204  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  60.69 
 
 
183 aa  204  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 
179 aa  204  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  56.42 
 
 
179 aa  204  5e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  54.49 
 
 
180 aa  204  6e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  53.67 
 
 
179 aa  202  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  57.31 
 
 
182 aa  202  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 
179 aa  203  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  53.93 
 
 
177 aa  202  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  54.49 
 
 
179 aa  202  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  54.49 
 
 
181 aa  202  2e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  53.63 
 
 
179 aa  202  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  55.06 
 
 
178 aa  201  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 
178 aa  202  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 
179 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 
179 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 
179 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 
178 aa  201  5e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  59.88 
 
 
184 aa  201  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  55.31 
 
 
179 aa  200  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 
179 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  53.93 
 
 
178 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  57.31 
 
 
182 aa  200  9.999999999999999e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 
179 aa  199  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 
179 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  53.93 
 
 
178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  54.59 
 
 
187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  52.51 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 
177 aa  198  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 
178 aa  198  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 
178 aa  198  3e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 
179 aa  197  7e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  55.49 
 
 
183 aa  197  9e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 
179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  53.63 
 
 
179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 
179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 
179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  52.51 
 
 
179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 
179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  53.63 
 
 
179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 
179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 
179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 
179 aa  195  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  55.14 
 
 
187 aa  195  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1852  50S ribosomal protein L6  53.85 
 
 
185 aa  195  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.668423 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1559  ribosomal protein L6  57.54 
 
 
179 aa  195  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000979408  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 
179 aa  195  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 
179 aa  195  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  55.43 
 
 
177 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 
180 aa  194  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 
178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0305  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 
176 aa  194  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.9924900000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 
177 aa  194  8.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  193  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  55.68 
 
 
177 aa  193  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 
177 aa  193  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 
177 aa  192  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2892  ribosomal protein L6  53.11 
 
 
180 aa  192  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  56.74 
 
 
179 aa  192  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  192  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 
181 aa  192  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  57.54 
 
 
180 aa  192  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 
178 aa  191  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  53.07 
 
 
179 aa  191  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  54.86 
 
 
177 aa  191  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  51.96 
 
 
179 aa  191  4e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  53.63 
 
 
180 aa  191  6e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  191  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 
178 aa  191  6e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>