More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1123 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1123  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 184 aa  369  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.611465  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  66.85 
 
 		 184 aa  263  1e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  69.02 
 
 		 184 aa  258  4e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  69.02 
 
 		 184 aa  258  4e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0775  ribosomal protein L6  52.75 
 
 		 186 aa  192  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 182 aa  187  8e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 178 aa  184  7e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  47.83 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  52.46 
 
 		 181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  48.63 
 
 		 177 aa  181  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  50.82 
 
 		 176 aa  180  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  47.54 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  47.54 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  51.1 
 
 		 180 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0713  50S ribosomal protein L6  52.46 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0735747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  50.81 
 
 		 179 aa  177  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  52.46 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  48.63 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  48.09 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  48.65 
 
 		 180 aa  175  3e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  46.7 
 
 		 179 aa  175  4e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 179 aa  175  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  50.55 
 
 		 178 aa  174  5e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  49.73 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 177 aa  174  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 179 aa  174  7e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  48.63 
 
 		 177 aa  174  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  47.54 
 
 		 177 aa  174  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 177 aa  174  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  49.73 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  49.73 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  43.72 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  44.81 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  44.81 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  44.81 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  52.25 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  48.09 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 182 aa  171  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 177 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 177 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 177 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  48.63 
 
 		 177 aa  171  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  49.18 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0338  ribosomal protein L6  44.81 
 
 		 175 aa  170  1e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0065  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654167  hitchhiker  0.0000000000000139653 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  48.11 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  48.91 
 
 		 179 aa  168  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 177 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  49.45 
 
 		 178 aa  168  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2981  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0075  50S ribosomal protein L6  44.26 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0536854  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0068  50S ribosomal protein L6  45.9 
 
 		 177 aa  167  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00100116  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 179 aa  168  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  46.2 
 
 		 180 aa  167  6e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  47.54 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  50 
 
 		 178 aa  167  7e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  46.2 
 
 		 180 aa  167  8e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  44.81 
 
 		 177 aa  167  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 177 aa  167  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0499  50S ribosomal protein L6  43.17 
 
 		 177 aa  167  9e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000112242  normal  0.0683389 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  45.11 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  45.6 
 
 		 181 aa  167  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0512  50S ribosomal protein L6  42.62 
 
 		 174 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000124699  unclonable  0.0000000000161683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0342  50S ribosomal protein L6  42.62 
 
 		 174 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.202734  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001727  LSU ribosomal protein L6p (L9e)  46.99 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000194026  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2159  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302064  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  49.46 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0334  50S ribosomal protein L6  48.09 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000427572  unclonable  0.0000000488908 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00745  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0490  50S ribosomal protein L6  45.09 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00133523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  44.81 
 
 		 177 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0782  ribosomal protein L6  45.9 
 
 		 177 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000462697  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  44.81 
 
 		 177 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 177 aa  165  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 182 aa  165  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 177 aa  165  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>