More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2154 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  100 
 
 		 176 aa  352  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 177 aa  226  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  64.97 
 
 		 177 aa  224  3e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  63.84 
 
 		 177 aa  224  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  62.71 
 
 		 177 aa  223  9e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  62.71 
 
 		 177 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0338  ribosomal protein L6  58.52 
 
 		 175 aa  213  8e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2357  50S ribosomal protein L6  60.45 
 
 		 177 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.700236  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00953  50S ribosomal protein L6  60.45 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0734749  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0420  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 176 aa  210  7.999999999999999e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146795  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0974  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  210  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234587  hitchhiker  0.00000109608 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0436  50S ribosomal protein L6P  56.25 
 
 		 176 aa  207  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0157307  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  58.99 
 
 		 178 aa  207  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0342  50S ribosomal protein L6  55.11 
 
 		 174 aa  205  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.202734  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0512  50S ribosomal protein L6  55.11 
 
 		 174 aa  205  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000124699  unclonable  0.0000000000161683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  204  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  204  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0504  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  203  9e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00191336  hitchhiker  0.0041563 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0509  50S ribosomal protein L6  58.29 
 
 		 175 aa  203  1e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.910827  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2617  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 176 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00663642  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3761  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 176 aa  202  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0024508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1939  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 176 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0207492  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3154  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 176 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0206863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3493  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 176 aa  202  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  203  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3789  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 176 aa  202  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3731  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 176 aa  202  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000218121  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0264  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 176 aa  202  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000279479  hitchhiker  0.0041278 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0448  50S ribosomal protein L6  57.71 
 
 		 175 aa  202  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.935491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0771  50S ribosomal protein L6  59.43 
 
 		 174 aa  201  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.787291  normal  0.0130716 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0291  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 176 aa  201  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000875703  normal  0.0218003 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3053  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 176 aa  201  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000512294  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0499  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  201  5e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000112242  normal  0.0683389 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0441  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  201  6e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296356  hitchhiker  0.000109216 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3462  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 176 aa  200  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000287307  decreased coverage  0.00473222 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0342  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 176 aa  200  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157965  normal  0.0125773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2744  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 176 aa  200  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000130297  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0363  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 176 aa  200  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000934657  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  200  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0616  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1004  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00326754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0282  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 176 aa  198  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00574931  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1839  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0352  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  55.11 
 
 		 176 aa  197  6e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  197  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3744  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640948  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  197  7.999999999999999e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0214  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000958159  unclonable  0.0000000000152518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0209  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000225303  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0173  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 176 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111848  decreased coverage  0.0000538106 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2824  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 176 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0379678  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0214  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000010053  hitchhiker  0.00000000158568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  194  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  193  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  193  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0246  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4155  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000600192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4041  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000805939  unclonable  0.00000000000307302 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0215  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000103444  hitchhiker  0.000114271 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0211  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000116546  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1037  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000958163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3428  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5055  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  190  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0037225  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4675  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 176 aa  190  9e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105609  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  189  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0490  50S ribosomal protein L6  53.01 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00133523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0396  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0491976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4302  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 176 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000025349  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0388  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000757352  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4228  50S ribosomal protein L6  54.22 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00495937  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  55.43 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  187  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0163  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  187  5.999999999999999e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  187  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3629  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 176 aa  187  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000298442  hitchhiker  0.0000000000176204 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  187  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3934  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  187  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0334  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000427572  unclonable  0.0000000488908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0329  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 176 aa  186  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00323508  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>