More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA2617 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2617  50S ribosomal protein L6  100 
 
 
176 aa  353  5e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00663642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3789  50S ribosomal protein L6  100 
 
 
176 aa  353  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3761  50S ribosomal protein L6  100 
 
 
176 aa  353  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0024508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1939  50S ribosomal protein L6  100 
 
 
176 aa  353  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0207492  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3493  50S ribosomal protein L6  100 
 
 
176 aa  353  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.393113  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3731  50S ribosomal protein L6  100 
 
 
176 aa  353  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000218121  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3154  50S ribosomal protein L6  100 
 
 
176 aa  353  5e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0206863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3053  50S ribosomal protein L6  98.3 
 
 
176 aa  348  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000512294  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2744  50S ribosomal protein L6  97.16 
 
 
176 aa  348  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000130297  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0363  50S ribosomal protein L6  97.16 
 
 
176 aa  348  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000934657  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0342  50S ribosomal protein L6  97.16 
 
 
176 aa  348  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157965  normal  0.0125773 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0291  50S ribosomal protein L6  96.59 
 
 
176 aa  347  6e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000875703  normal  0.0218003 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3462  50S ribosomal protein L6  96.02 
 
 
176 aa  345  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000287307  decreased coverage  0.00473222 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0264  50S ribosomal protein L6  96.59 
 
 
176 aa  344  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000279479  hitchhiker  0.0041278 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0282  50S ribosomal protein L6  96.02 
 
 
176 aa  344  4e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00574931  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3629  50S ribosomal protein L6  86.93 
 
 
176 aa  315  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000298442  hitchhiker  0.0000000000176204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0329  50S ribosomal protein L6  86.36 
 
 
176 aa  312  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00323508  decreased coverage  0.00332979 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2824  50S ribosomal protein L6  85.8 
 
 
176 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0379678  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  76.27 
 
 
177 aa  272  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  75.14 
 
 
177 aa  270  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  75.14 
 
 
177 aa  269  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  74.58 
 
 
177 aa  265  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  73.45 
 
 
177 aa  262  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0420  50S ribosomal protein L6  72.32 
 
 
176 aa  255  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146795  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  70.06 
 
 
177 aa  248  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3428  50S ribosomal protein L6  68.93 
 
 
177 aa  244  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3934  50S ribosomal protein L6  65.54 
 
 
177 aa  241  5e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1037  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 
177 aa  229  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000958163  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0388  50S ribosomal protein L6  62.71 
 
 
177 aa  228  3e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000757352  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0396  50S ribosomal protein L6  62.71 
 
 
177 aa  228  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0491976  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0068  50S ribosomal protein L6  64.97 
 
 
177 aa  228  5e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00100116  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0065  50S ribosomal protein L6  64.97 
 
 
177 aa  227  8e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654167  hitchhiker  0.0000000000000139653 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0782  ribosomal protein L6  61.02 
 
 
177 aa  226  2e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000462697  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0334  50S ribosomal protein L6  65.54 
 
 
176 aa  223  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000427572  unclonable  0.0000000488908 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0616  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 
177 aa  222  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.192934  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5055  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 
177 aa  221  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0037225  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  60.45 
 
 
177 aa  218  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0490  50S ribosomal protein L6  62.65 
 
 
177 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00133523  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 
177 aa  216  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0335  50S ribosomal protein L6  62.05 
 
 
177 aa  215  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000198862  hitchhiker  0.000458858 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00953  50S ribosomal protein L6  60.45 
 
 
177 aa  214  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0734749  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 
177 aa  209  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 
177 aa  209  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 
177 aa  208  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 
177 aa  208  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 
177 aa  208  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 
177 aa  208  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4228  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 
177 aa  207  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00495937  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 
177 aa  207  6e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 
177 aa  207  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 
177 aa  207  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0173  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 
176 aa  206  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111848  decreased coverage  0.0000538106 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0294  50S ribosomal protein L6P  57.06 
 
 
177 aa  206  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000550047  hitchhiker  0.00000213592 
 
 
 
NC_008577  Shewana3_0214  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 
177 aa  206  1e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000010053  hitchhiker  0.00000000158568 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4041  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 
177 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000805939  unclonable  0.00000000000307302 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0215  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 
177 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000103444  hitchhiker  0.000114271 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4155  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 
177 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000600192  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  58.19 
 
 
177 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0211  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 
177 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000116546  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1004  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 
177 aa  206  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00326754  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3744  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 
177 aa  205  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640948  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0352  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 
178 aa  205  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0214  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 
177 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000958159  unclonable  0.0000000000152518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0209  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 
177 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000225303  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0163  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 
177 aa  206  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1839  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 
178 aa  205  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 
177 aa  206  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 
176 aa  205  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0441  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 
177 aa  204  5e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296356  hitchhiker  0.000109216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0246  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 
177 aa  204  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0185  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 
177 aa  203  8e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922994  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  57.06 
 
 
176 aa  202  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2357  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 
177 aa  202  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.700236  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  57.06 
 
 
177 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0342  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 
174 aa  202  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.202734  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0512  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 
174 aa  202  3e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000124699  unclonable  0.0000000000161683 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0499  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 
177 aa  201  6e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000112242  normal  0.0683389 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  56.74 
 
 
178 aa  200  9e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4675  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 
176 aa  200  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105609  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03156  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 
177 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000273178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0408  ribosomal protein L6 signature 1  58.19 
 
 
177 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001181  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3499  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 
177 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000406274  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 
177 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0504  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 
177 aa  199  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00191336  hitchhiker  0.0041563 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0408  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 
177 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000304254  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3788  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 
177 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000156973  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4628  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 
177 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000296835  normal  0.936677 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3690  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 
177 aa  199  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000170909  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3600  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 
177 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00731053  normal  0.0167726 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03107  hypothetical protein  58.19 
 
 
177 aa  199  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000133235  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4302  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000025349  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 
177 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00745  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 
177 aa  197  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3694  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 
177 aa  197  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0880192  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3729  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 
177 aa  197  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0348679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3621  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 
177 aa  197  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000291027  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3621  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 
177 aa  197  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0403056  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0335  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 
177 aa  197  9e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000240759  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001727  LSU ribosomal protein L6p (L9e)  58.19 
 
 
177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000194026  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 
177 aa  195  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>