More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1971 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 177 aa  350  7e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  98.31 
 
 		 177 aa  344  4e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  98.31 
 
 		 177 aa  344  4e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  82.49 
 
 		 177 aa  299  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0713  50S ribosomal protein L6  79.66 
 
 		 177 aa  296  9e-80  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0735747  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  79.1 
 
 		 177 aa  283  8e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1347  50S ribosomal protein L6  77.97 
 
 		 177 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000134886  normal  0.277418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1445  50S ribosomal protein L6  77.97 
 
 		 177 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  78.53 
 
 		 177 aa  282  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  73.45 
 
 		 177 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  73.45 
 
 		 177 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  73.45 
 
 		 177 aa  267  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2203  50S ribosomal protein L6  74.01 
 
 		 177 aa  263  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0750089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  73.45 
 
 		 177 aa  263  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  70.06 
 
 		 177 aa  258  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0338  50S ribosomal protein L6  71.19 
 
 		 177 aa  255  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  70.06 
 
 		 177 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  70.06 
 
 		 177 aa  249  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  68.36 
 
 		 177 aa  248  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  67.23 
 
 		 177 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  65.54 
 
 		 177 aa  243  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  63.28 
 
 		 177 aa  243  9e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  66.1 
 
 		 177 aa  240  7e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  63.84 
 
 		 177 aa  240  7.999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  64.97 
 
 		 177 aa  237  6.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  62.71 
 
 		 177 aa  235  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  62.71 
 
 		 177 aa  234  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  230  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 177 aa  230  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  226  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  225  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  224  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  224  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 177 aa  221  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  59.89 
 
 		 177 aa  218  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  215  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  210  7.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  204  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  204  8e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  201  5e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  200  8e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1931  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00745  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  56.57 
 
 		 179 aa  191  4e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2981  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  191  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  54.24 
 
 		 177 aa  191  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2159  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  191  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302064  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001727  LSU ribosomal protein L6p (L9e)  51.98 
 
 		 177 aa  190  8e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000194026  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 176 aa  190  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  54.55 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  52.57 
 
 		 180 aa  188  4e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 178 aa  187  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0068  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  187  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00100116  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0099  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 178 aa  187  8e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.492804  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0065  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  187  9e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654167  hitchhiker  0.0000000000000139653 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  52.57 
 
 		 178 aa  186  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  53.71 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3694  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0880192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3621  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0403056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3729  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0348679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 180 aa  186  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3621  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000291027  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0335  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000240759  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4529  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000152303  hitchhiker  0.000162155 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0163  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03156  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000273178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0408  ribosomal protein L6 signature 1  50.85 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03107  hypothetical protein  50.85 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000133235  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3986  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0087686  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  53.71 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  55.11 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3788  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000156973  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4628  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000296835  normal  0.936677 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3499  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000406274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3690  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000170909  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3600  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00731053  normal  0.0167726 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3744  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  185  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0408  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000304254  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3736  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000312741  decreased coverage  0.00108821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4675  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 176 aa  184  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105609  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0214  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000010053  hitchhiker  0.00000000158568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 178 aa  184  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>