More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2981 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2981  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 177 aa  355  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1931  50S ribosomal protein L6  66.67 
 
 		 177 aa  254  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  210  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  204  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  204  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  200  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2203  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0750089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0338  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 		 177 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  193  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  191  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  190  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  189  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  189  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0713  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0735747  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  187  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  187  8e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  187  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1445  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1347  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000134886  normal  0.277418 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0420  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 176 aa  185  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146795  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  50.28 
 
 		 177 aa  184  7e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  184  8e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  46.33 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  177  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  45.76 
 
 		 177 aa  177  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0163  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  46.33 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03156  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  173  9e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000273178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0408  ribosomal protein L6 signature 1  50.85 
 
 		 177 aa  173  9e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3788  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  173  9e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000156973  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4628  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  173  9e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000296835  normal  0.936677 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0408  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  173  9e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000304254  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3499  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  173  9e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000406274  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  46.33 
 
 		 177 aa  173  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03107  hypothetical protein  50.85 
 
 		 177 aa  173  9e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000133235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3600  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  173  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00731053  normal  0.0167726 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3690  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  173  9e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000170909  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  50 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3729  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0348679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3621  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000291027  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3621  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0403056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3694  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0880192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  46.33 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0266  ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0436  50S ribosomal protein L6P  48.02 
 
 		 176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0157307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1559  ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000979408  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3934  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0185  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922994  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3792  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  48.09 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  48.09 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0214  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000010053  hitchhiker  0.00000000158568 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3736  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000312741  decreased coverage  0.00108821 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3428  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 176 aa  171  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0075  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 177 aa  171  6.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0536854  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  170  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0342  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 174 aa  169  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.202734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 178 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0782  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000462697  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0214  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000958159  unclonable  0.0000000000152518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0209  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000225303  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0512  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 174 aa  169  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000124699  unclonable  0.0000000000161683 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0420  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00669543  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0334  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000427572  unclonable  0.0000000488908 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00745  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0338  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3744  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640948  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  49.72 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2357  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.700236  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0681  50S ribosomal protein L6  46.59 
 
 		 180 aa  168  3e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1123  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 184 aa  168  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.611465  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1004  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00326754  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>