More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1559 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1559  ribosomal protein L6  100 
 
 		 179 aa  358  3e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000979408  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  55.62 
 
 		 177 aa  197  9e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  57.54 
 
 		 178 aa  195  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  189  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 177 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 177 aa  187  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  52.51 
 
 		 180 aa  187  8e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  187  9e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 178 aa  185  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 177 aa  184  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  53.63 
 
 		 179 aa  184  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0266  ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  183  9e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  54.19 
 
 		 181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 178 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  181  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 178 aa  181  6e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  51.67 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 180 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 178 aa  177  8e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  51.11 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 179 aa  177  9e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 180 aa  175  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 180 aa  175  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  174  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  52.6 
 
 		 183 aa  174  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 180 aa  174  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  174  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  47.75 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  50.29 
 
 		 183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1162  50S ribosomal protein L6  50.55 
 
 		 180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000404659  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  46.59 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2981  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  51.45 
 
 		 182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 182 aa  171  5e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  50.84 
 
 		 179 aa  171  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 178 aa  171  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1722  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0239785  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  49.16 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  50.56 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  48.04 
 
 		 178 aa  168  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 		 177 aa  169  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1347  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 177 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000134886  normal  0.277418 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  49.18 
 
 		 184 aa  168  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 178 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  46.37 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  47.49 
 
 		 177 aa  169  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  47.19 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 179 aa  167  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  167  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1445  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 177 aa  168  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 		 176 aa  167  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0713  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 177 aa  167  9e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0735747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>