More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1931 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1931  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 177 aa  358  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2981  50S ribosomal protein L6  66.67 
 
 		 177 aa  254  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  207  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  204  6e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  55.93 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  202  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  194  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  194  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  194  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  194  8.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  193  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  191  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  191  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  191  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  190  7e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  190  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  189  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0338  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  187  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2203  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  185  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0750089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  53.33 
 
 		 177 aa  185  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 178 aa  184  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  184  7e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0713  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0735747  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  181  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3428  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3934  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 177 aa  177  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 177 aa  177  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 177 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0342  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 174 aa  175  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.202734  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0512  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 174 aa  175  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000124699  unclonable  0.0000000000161683 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 177 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1445  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  46.86 
 
 		 178 aa  175  4e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  175  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0436  50S ribosomal protein L6P  50.85 
 
 		 176 aa  174  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0157307  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0211  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 178 aa  174  8e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1347  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000134886  normal  0.277418 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0163  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  45.45 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0185  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922994  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0214  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000010053  hitchhiker  0.00000000158568 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0420  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 176 aa  171  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146795  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 177 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 178 aa  170  9e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0214  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 177 aa  170  9e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000958159  unclonable  0.0000000000152518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0209  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 177 aa  170  9e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000225303  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3744  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640948  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 		 180 aa  169  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 		 179 aa  168  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0246  50S ribosomal protein L6  46.33 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0334  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 176 aa  168  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000427572  unclonable  0.0000000488908 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 178 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4155  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000600192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4041  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000805939  unclonable  0.00000000000307302 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 178 aa  168  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1004  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00326754  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0215  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000103444  hitchhiker  0.000114271 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0211  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000116546  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 179 aa  167  7e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1860  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 178 aa  167  9e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 178 aa  167  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 184 aa  167  9e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 184 aa  167  9e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1689  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 178 aa  167  9e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.267616  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3053  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 176 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000512294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>