More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1307 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 184 aa  364  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 184 aa  364  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  73.91 
 
 		 184 aa  280  1e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1123  50S ribosomal protein L6  69.02 
 
 		 184 aa  258  4e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.611465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0775  ribosomal protein L6  51.1 
 
 		 186 aa  197  7e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  57.3 
 
 		 181 aa  191  3e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  54.4 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  53.85 
 
 		 178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  51.37 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  54.1 
 
 		 178 aa  184  8e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  51.61 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  52.46 
 
 		 180 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0713  50S ribosomal protein L6  51.37 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0735747  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0342  50S ribosomal protein L6  47.54 
 
 		 174 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.202734  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0512  50S ribosomal protein L6  47.54 
 
 		 174 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000124699  unclonable  0.0000000000161683 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  51.35 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  51.35 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  51.35 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  51.35 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  51.35 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  51.35 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  51.35 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  51.35 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  51.35 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  48.35 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  53.01 
 
 		 178 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  54.1 
 
 		 180 aa  177  8e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 182 aa  177  9e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  48.63 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  47.03 
 
 		 180 aa  175  3e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  50.81 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  48.37 
 
 		 180 aa  175  4e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0382  50S ribosomal protein L6  50.53 
 
 		 180 aa  174  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95579  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  50.55 
 
 		 178 aa  174  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  45.9 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  44.26 
 
 		 177 aa  174  7e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  47.54 
 
 		 177 aa  174  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 182 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  50.55 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  50.54 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  49.72 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  48.63 
 
 		 176 aa  171  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  46.74 
 
 		 178 aa  171  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  48.15 
 
 		 184 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2981  50S ribosomal protein L6  48.09 
 
 		 177 aa  171  6.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 177 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  47.25 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  46.74 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  43.48 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  50.54 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  47.83 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  47.8 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  50.82 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  47.83 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  50.55 
 
 		 178 aa  169  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  45.9 
 
 		 177 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0617  ribosomal protein L6  47.62 
 
 		 185 aa  169  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0681  50S ribosomal protein L6  45.41 
 
 		 180 aa  167  7e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 177 aa  167  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  50.84 
 
 		 183 aa  167  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2159  50S ribosomal protein L6  47.54 
 
 		 177 aa  167  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302064  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0499  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 177 aa  167  8e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000112242  normal  0.0683389 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  49.73 
 
 		 181 aa  167  9e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4675  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 176 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105609  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  44.81 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1468  50S ribosomal protein L6  47.8 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108957  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1931  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  44.81 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  45.9 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  45.95 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0801  50S ribosomal protein L6  47.83 
 
 		 183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00557608  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  49.45 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3899  50S ribosomal protein L6  44.81 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139368  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0598  50S ribosomal protein L6  44.81 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000013887  normal  0.735029 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  48.63 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  48.63 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0298  50S ribosomal protein L6  44.81 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000138851  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  47.28 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0264  50S ribosomal protein L6  45.9 
 
 		 176 aa  165  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000279479  hitchhiker  0.0041278 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  47.83 
 
 		 180 aa  164  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 177 aa  165  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0173  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 176 aa  165  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111848  decreased coverage  0.0000538106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 177 aa  165  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 177 aa  165  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4302  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 176 aa  165  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000025349  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3053  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 176 aa  164  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000512294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>