More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2673 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 177 aa  358  3e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  224  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  217  7e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  216  8.999999999999998e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  216  8.999999999999998e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2203  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  216  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0750089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0338  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 177 aa  215  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  61.02 
 
 		 177 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  214  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  214  7e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  214  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  213  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  213  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  211  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0713  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  210  7e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0735747  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  210  7.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1445  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  210  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2981  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  210  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1347  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  208  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000134886  normal  0.277418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1931  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  207  6e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  207  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  203  9e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  200  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  200  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  197  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  54.24 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  193  9e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  190  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0512  50S ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 174 aa  189  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000124699  unclonable  0.0000000000161683 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  189  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0342  50S ribosomal protein L6  53.33 
 
 		 174 aa  189  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.202734  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0065  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654167  hitchhiker  0.0000000000000139653 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0068  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00100116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2357  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.700236  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0420  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 176 aa  181  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146795  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 181 aa  182  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0334  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 176 aa  180  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000427572  unclonable  0.0000000488908 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 176 aa  180  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1162  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000404659  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0782  ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000462697  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0294  50S ribosomal protein L6P  50 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000550047  hitchhiker  0.00000213592 
 
 
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4529  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000152303  hitchhiker  0.000162155 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0388  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000757352  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0396  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0491976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  178  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03156  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000273178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0408  ribosomal protein L6 signature 1  50.28 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4628  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000296835  normal  0.936677 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0408  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000304254  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03107  hypothetical protein  50.28 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000133235  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3690  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000170909  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3499  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000406274  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3788  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000156973  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3600  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00731053  normal  0.0167726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3694  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  177  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0880192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3621  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  177  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000291027  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3729  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  177  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0348679 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  177  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3621  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  177  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0403056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3899  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  177  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139368  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0298  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  177  9e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000138851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0598  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  177  9e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000013887  normal  0.735029 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3792  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05795  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0448  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 175 aa  176  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.935491  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>