More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05795 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05795  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 180 aa  360  9e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0382  50S ribosomal protein L6  74.44 
 
 		 180 aa  281  4.0000000000000003e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95579  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1162  50S ribosomal protein L6  73.33 
 
 		 180 aa  275  3e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000404659  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0617  ribosomal protein L6  62.64 
 
 		 185 aa  229  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1923  50S ribosomal protein L6  62.43 
 
 		 183 aa  227  8e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3147  50S ribosomal protein L6  57.69 
 
 		 184 aa  211  5.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042273  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1630  ribosomal protein L6  56.59 
 
 		 184 aa  211  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4358  ribosomal protein L6  57.69 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000653626  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5772  ribosomal protein L6  56.59 
 
 		 185 aa  207  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245176  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  56.59 
 
 		 184 aa  204  6e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0182  50S ribosomal protein L6  58.24 
 
 		 184 aa  204  7e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  55.8 
 
 		 180 aa  191  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  54.1 
 
 		 179 aa  184  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  52.49 
 
 		 179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  51.35 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  52.17 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  52.17 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  50.83 
 
 		 178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  49.72 
 
 		 181 aa  177  4.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  49.17 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 178 aa  177  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  51.38 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  49.45 
 
 		 180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  49.73 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 177 aa  171  6.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 176 aa  169  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  53.98 
 
 		 183 aa  170  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  48.62 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 177 aa  167  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  48.07 
 
 		 182 aa  167  9e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  46.15 
 
 		 180 aa  167  9e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  48.07 
 
 		 179 aa  167  9e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  49.17 
 
 		 179 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 183 aa  166  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  48.62 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0173  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 176 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111848  decreased coverage  0.0000538106 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  48.9 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  46.96 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  51.4 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  46.41 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 187 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  164  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  46.96 
 
 		 177 aa  165  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  46.96 
 
 		 179 aa  164  5e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  48.62 
 
 		 179 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  46.41 
 
 		 179 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4675  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105609  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  48.9 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  46.96 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  46.41 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0163  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  47.51 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1559  ribosomal protein L6  45.05 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000979408  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4302  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000025349  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0185  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922994  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  46.7 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  49.45 
 
 		 180 aa  161  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  46.15 
 
 		 179 aa  161  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 177 aa  161  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  49.45 
 
 		 180 aa  160  7e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  48.85 
 
 		 182 aa  160  7e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  45.3 
 
 		 181 aa  160  8.000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  48.35 
 
 		 180 aa  160  8.000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 177 aa  160  9e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  52.84 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  45.11 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  44.51 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  48.07 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  46.37 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  45.05 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 180 aa  159  2e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  44.75 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  42.93 
 
 		 178 aa  158  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  44.57 
 
 		 178 aa  158  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  45.3 
 
 		 181 aa  158  3e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  45.3 
 
 		 179 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  46.96 
 
 		 177 aa  159  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  46.49 
 
 		 185 aa  158  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  45.9 
 
 		 178 aa  158  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>