More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1162 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1162  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 180 aa  359  1e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000404659  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0382  50S ribosomal protein L6  75 
 
 		 180 aa  276  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95579  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05795  50S ribosomal protein L6  73.33 
 
 		 180 aa  275  3e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0617  ribosomal protein L6  68.68 
 
 		 185 aa  246  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1923  50S ribosomal protein L6  65.75 
 
 		 183 aa  234  5.0000000000000005e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1630  ribosomal protein L6  61.54 
 
 		 184 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5772  ribosomal protein L6  57.69 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245176  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3147  50S ribosomal protein L6  57.69 
 
 		 184 aa  201  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042273  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4358  ribosomal protein L6  56.59 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000653626  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0182  50S ribosomal protein L6  54.95 
 
 		 184 aa  195  3e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  53.3 
 
 		 184 aa  188  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  53.04 
 
 		 181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  50.84 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  50.83 
 
 		 181 aa  174  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03156  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000273178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0408  ribosomal protein L6 signature 1  50.84 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001181  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3792  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0408  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000304254  hitchhiker  0.00000262117 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4628  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000296835  normal  0.936677 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3600  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00731053  normal  0.0167726 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3788  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000156973  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03107  hypothetical protein  50.84 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000133235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3499  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000406274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3690  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000170909  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3729  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 177 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0348679 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0598  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 177 aa  174  9e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000013887  normal  0.735029 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3621  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 177 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000291027  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3899  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 177 aa  174  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139368  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  52.75 
 
 		 179 aa  173  9e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0298  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 177 aa  174  9e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000138851  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3694  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 177 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0880192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3621  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 177 aa  174  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0403056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  49.17 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  50 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00745  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001727  LSU ribosomal protein L6p (L9e)  52.51 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000194026  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  47.8 
 
 		 180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1559  ribosomal protein L6  50.55 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000979408  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  49.17 
 
 		 180 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0420  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00669543  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3736  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000312741  decreased coverage  0.00108821 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0068  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00100116  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0338  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000132809  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  48.89 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  51.96 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4529  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000152303  hitchhiker  0.000162155 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0065  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654167  hitchhiker  0.0000000000000139653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  170  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  49.17 
 
 		 182 aa  170  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  53.59 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  53.59 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0075  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  169  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0536854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 177 aa  167  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0163  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  167  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  49.17 
 
 		 179 aa  167  6e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0335  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000240759  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3807  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 177 aa  167  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3986  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  167  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0087686  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2159  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 177 aa  167  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302064  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  49.17 
 
 		 179 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0185  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922994  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0436  50S ribosomal protein L6P  50.84 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0157307  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  49.17 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4675  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105609  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  47.51 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  49.45 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1004  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  164  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00326754  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  50.83 
 
 		 178 aa  164  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1018  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000674747  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0049  50S ribosomal protein L6  49.18 
 
 		 178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.560841  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 177 aa  164  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 178 aa  164  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1761  50S ribosomal protein L6  49.45 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00139046  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  50.81 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  48.63 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0974  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234587  hitchhiker  0.00000109608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  49.17 
 
 		 180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  48.89 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  46.96 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>