More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0382 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0382  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 180 aa  356  9e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95579  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05795  50S ribosomal protein L6  74.44 
 
 		 180 aa  281  4.0000000000000003e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1162  50S ribosomal protein L6  75 
 
 		 180 aa  276  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000404659  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1923  50S ribosomal protein L6  64.09 
 
 		 183 aa  229  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0617  ribosomal protein L6  62.09 
 
 		 185 aa  227  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1630  ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 184 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0182  50S ribosomal protein L6  57.69 
 
 		 184 aa  207  8e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4358  ribosomal protein L6  57.14 
 
 		 185 aa  206  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000653626  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5772  ribosomal protein L6  56.59 
 
 		 185 aa  205  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245176  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3147  50S ribosomal protein L6  57.69 
 
 		 184 aa  206  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042273  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  55.74 
 
 		 184 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  56.11 
 
 		 178 aa  184  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  54.7 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  54.7 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  51.93 
 
 		 181 aa  181  6e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 182 aa  181  7e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  52.49 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  52.75 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  52.75 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  52.75 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  52.75 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  52.75 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  52.75 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  52.75 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  52.75 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  52.75 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  52.2 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  48.62 
 
 		 180 aa  174  4e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 178 aa  175  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  50.53 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  50.53 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  47.22 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  52.75 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  52.2 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  49.17 
 
 		 182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 178 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 183 aa  170  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  48.9 
 
 		 180 aa  170  9e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  49.18 
 
 		 187 aa  170  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 180 aa  169  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  52.2 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  51.38 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 178 aa  169  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  52.27 
 
 		 183 aa  167  5e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  51.91 
 
 		 179 aa  167  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  51.14 
 
 		 183 aa  167  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  51.93 
 
 		 180 aa  166  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  48.07 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  47.22 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  50.83 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  46.96 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  48.09 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 179 aa  165  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1852  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 185 aa  164  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.668423 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27601  Plastid ribosomal protein L6 large ribosomal subunit  48.31 
 
 		 213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.935341  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  49.16 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  47.8 
 
 		 179 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  49.17 
 
 		 180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  47.28 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  48.35 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0211  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  46.7 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  46.93 
 
 		 177 aa  161  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 176 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  48.62 
 
 		 177 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 179 aa  160  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  50.28 
 
 		 178 aa  160  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 179 aa  160  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  47.54 
 
 		 187 aa  160  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  46.41 
 
 		 179 aa  160  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  48.07 
 
 		 178 aa  160  9e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  47.51 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  47.22 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  44.69 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 178 aa  159  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0185  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922994  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1146  ribosomal protein L6  52.75 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000104709  hitchhiker  0.00466337 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  48.85 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  48.07 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  46.67 
 
 		 178 aa  158  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 182 aa  159  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  158  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0173  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 176 aa  158  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111848  decreased coverage  0.0000538106 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0163  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 177 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  48.62 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  46.7 
 
 		 180 aa  158  4e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>