More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1630 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1630  ribosomal protein L6  100 
 
 		 184 aa  365  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0617  ribosomal protein L6  67.39 
 
 		 185 aa  260  8e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4358  ribosomal protein L6  61.41 
 
 		 185 aa  236  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000653626  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5772  ribosomal protein L6  61.41 
 
 		 185 aa  235  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245176  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3147  50S ribosomal protein L6  61.96 
 
 		 184 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042273  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  58.15 
 
 		 184 aa  229  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0182  50S ribosomal protein L6  61.96 
 
 		 184 aa  221  6e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_002950  PG1923  50S ribosomal protein L6  59.46 
 
 		 183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1162  50S ribosomal protein L6  61.54 
 
 		 180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000404659  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0382  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 180 aa  213  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95579  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05795  50S ribosomal protein L6  56.59 
 
 		 180 aa  211  7e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  54.64 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  54.64 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  54.95 
 
 		 178 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  54.95 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  54.95 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  54.95 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  54.95 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  54.95 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  54.95 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  54.95 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  54.95 
 
 		 179 aa  191  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  53.85 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  54.35 
 
 		 179 aa  187  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  53.3 
 
 		 178 aa  187  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  50.81 
 
 		 180 aa  187  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  51.63 
 
 		 182 aa  186  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  51.09 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  50.55 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  52.72 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  51.63 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  51.08 
 
 		 179 aa  181  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  52.43 
 
 		 178 aa  180  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  50.54 
 
 		 180 aa  180  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  50.55 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 182 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  50.54 
 
 		 187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  51.35 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 181 aa  178  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  51.37 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  48.35 
 
 		 178 aa  177  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  51.09 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  48.39 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  51.63 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  50.54 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 177 aa  175  4e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  48.35 
 
 		 178 aa  175  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  49.46 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  51.72 
 
 		 184 aa  174  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  49.19 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  48.91 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  50.54 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  48.91 
 
 		 178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  50.54 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  47.83 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  171  7.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0068  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  170  9e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00100116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  170  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  50.27 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0065  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654167  hitchhiker  0.0000000000000139653 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  49.45 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  50 
 
 		 183 aa  169  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  48.89 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  48.09 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  51.63 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  51.14 
 
 		 183 aa  168  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  47.28 
 
 		 180 aa  168  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  46.74 
 
 		 179 aa  168  5e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  49.73 
 
 		 179 aa  167  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  47.57 
 
 		 179 aa  167  7e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 179 aa  167  8e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 177 aa  167  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0420  50S ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 176 aa  167  9e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146795  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  47.83 
 
 		 178 aa  167  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  50.8 
 
 		 180 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  47.28 
 
 		 179 aa  167  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  51.37 
 
 		 178 aa  167  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  46.24 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  48.07 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  48.65 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  49.17 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  48.09 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>