More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0182 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0182  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 184 aa  368  1e-101  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5772  ribosomal protein L6  65.22 
 
 		 185 aa  248  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245176  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3147  50S ribosomal protein L6  61.96 
 
 		 184 aa  229  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042273  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4358  ribosomal protein L6  60.87 
 
 		 185 aa  229  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000653626  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_002950  PG1923  50S ribosomal protein L6  59.24 
 
 		 183 aa  227  8e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0617  ribosomal protein L6  59.78 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  57.61 
 
 		 184 aa  221  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1630  ribosomal protein L6  61.96 
 
 		 184 aa  221  6e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0382  50S ribosomal protein L6  57.69 
 
 		 180 aa  207  8e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95579  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05795  50S ribosomal protein L6  58.24 
 
 		 180 aa  204  8e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1162  50S ribosomal protein L6  54.95 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000404659  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  50.54 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  51.61 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  50.54 
 
 		 182 aa  176  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 179 aa  174  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  50.55 
 
 		 179 aa  174  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  50.55 
 
 		 179 aa  174  7e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  174  9e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  51.09 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  45.95 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  51.1 
 
 		 178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  49.45 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  49.45 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  49.45 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  49.45 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  49.45 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  49.45 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  49.45 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  49.45 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  47.28 
 
 		 179 aa  170  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  47.28 
 
 		 179 aa  170  9e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  50 
 
 		 180 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  49.45 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  49.2 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  48.35 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 180 aa  168  3e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 179 aa  167  8e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  45.65 
 
 		 180 aa  167  9e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 187 aa  167  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  47.31 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  47.28 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  47.83 
 
 		 178 aa  165  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  48.39 
 
 		 179 aa  164  5e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  47.83 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2050  ribosomal protein L6  46.74 
 
 		 178 aa  164  8e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.0184636 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  47.31 
 
 		 179 aa  164  9e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  48.91 
 
 		 179 aa  164  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  46.24 
 
 		 179 aa  164  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  47.25 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  48.9 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  48.66 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  48.35 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  47.8 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  47.83 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  44.57 
 
 		 179 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  47.83 
 
 		 180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  48.35 
 
 		 178 aa  161  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  47.28 
 
 		 179 aa  160  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  48.07 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  48.89 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  47.03 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  49.2 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  48.07 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  46.67 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  46.7 
 
 		 180 aa  159  2e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  46.15 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  47.28 
 
 		 179 aa  159  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  44.02 
 
 		 180 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  46.15 
 
 		 177 aa  158  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0681  50S ribosomal protein L6  46.74 
 
 		 180 aa  158  4e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  48.9 
 
 		 178 aa  158  4e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  47.75 
 
 		 182 aa  158  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  47.8 
 
 		 181 aa  158  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  47.25 
 
 		 177 aa  157  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  45.11 
 
 		 179 aa  157  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  47.03 
 
 		 179 aa  157  7e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  48.09 
 
 		 179 aa  157  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 179 aa  157  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  43.92 
 
 		 184 aa  157  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  43.92 
 
 		 184 aa  157  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  46.2 
 
 		 179 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  47.54 
 
 		 179 aa  155  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  47.03 
 
 		 180 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  46.7 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  46.81 
 
 		 179 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 179 aa  155  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  46.81 
 
 		 179 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  48.92 
 
 		 180 aa  155  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  47.03 
 
 		 179 aa  155  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  47.28 
 
 		 180 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  46.52 
 
 		 180 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  47.7 
 
 		 184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>