More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0782 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 179 aa  358  2e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 180 aa  191  5e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 179 aa  188  5e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 179 aa  187  9e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  53.59 
 
 		 180 aa  185  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  184  8e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  52.54 
 
 		 181 aa  181  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  48.89 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 178 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  51.45 
 
 		 183 aa  178  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 184 aa  175  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  48.89 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1018  50S ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000674747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  48.84 
 
 		 182 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  49.17 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1860  50S ribosomal protein L6  47.22 
 
 		 178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0074  50S ribosomal protein L6  47.22 
 
 		 178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1689  50S ribosomal protein L6  47.22 
 
 		 178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.267616  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 178 aa  171  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0492  ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 178 aa  171  5e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187085  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  47.19 
 
 		 178 aa  170  7.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  170  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2066  50S ribosomal protein L6  46.67 
 
 		 178 aa  168  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  47.22 
 
 		 182 aa  168  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 178 aa  167  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1761  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 178 aa  167  7e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00139046  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  51.16 
 
 		 183 aa  167  7e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2050  ribosomal protein L6  47.49 
 
 		 178 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.0184636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  46.11 
 
 		 179 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1559  ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000979408  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  48.89 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  46.33 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  46.07 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  47.19 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  46.63 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  48.31 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  48.31 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  48.55 
 
 		 183 aa  165  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  45.95 
 
 		 187 aa  165  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27601  Plastid ribosomal protein L6 large ribosomal subunit  48.59 
 
 		 213 aa  164  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.935341  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  49.72 
 
 		 179 aa  164  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  46.07 
 
 		 178 aa  164  5.9999999999999996e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  48.84 
 
 		 182 aa  164  6.9999999999999995e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  46.89 
 
 		 180 aa  164  9e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0382  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  45.61 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  48.86 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  47.19 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0723  50S ribosomal protein L6  45.45 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0843452  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  47.73 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  44.38 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  47.22 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  46.63 
 
 		 179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0049  50S ribosomal protein L6  45 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.560841  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  46.67 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  46.07 
 
 		 180 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  48.35 
 
 		 180 aa  162  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 179 aa  161  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  47.19 
 
 		 179 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 179 aa  161  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 179 aa  161  6e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  49.17 
 
 		 180 aa  160  7e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  47.22 
 
 		 179 aa  160  7e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1241  50S ribosomal protein L6  48.35 
 
 		 179 aa  160  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138167  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 179 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  48.31 
 
 		 179 aa  160  9e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  46.63 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_002950  PG1923  50S ribosomal protein L6  45.65 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  46.11 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  48.21 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  47.09 
 
 		 182 aa  159  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  46.07 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  46.93 
 
 		 180 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  44.13 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  46.37 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1722  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0239785  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  46.59 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  48.07 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  46.63 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  46.67 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>