More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1892 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 178 aa  355  2.9999999999999997e-97  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  87.64 
 
 		 178 aa  312  1.9999999999999998e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  75.84 
 
 		 178 aa  267  7e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  62.36 
 
 		 178 aa  218  3e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 178 aa  216  1e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  60.89 
 
 		 179 aa  215  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 178 aa  215  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  61.45 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  59.78 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  59.78 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  61.24 
 
 		 178 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  60.34 
 
 		 179 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  60.67 
 
 		 178 aa  209  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  60.67 
 
 		 178 aa  209  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  58.76 
 
 		 177 aa  208  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  58.43 
 
 		 181 aa  205  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  58.52 
 
 		 180 aa  204  4e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  59.55 
 
 		 179 aa  204  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  204  6e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  54.49 
 
 		 180 aa  200  9e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1468  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 		 178 aa  199  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108957  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0305  50S ribosomal protein L6  58.43 
 
 		 176 aa  197  5e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.9924900000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 182 aa  197  9e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  57.89 
 
 		 183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  53.8 
 
 		 182 aa  194  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 179 aa  192  3e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  54.49 
 
 		 178 aa  191  6e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  55.81 
 
 		 183 aa  190  8e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  53.22 
 
 		 182 aa  190  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  53.49 
 
 		 183 aa  188  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 180 aa  187  8e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  52.63 
 
 		 182 aa  186  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  51.89 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 178 aa  185  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  53.85 
 
 		 184 aa  184  7e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  54.1 
 
 		 184 aa  184  8e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  54.1 
 
 		 184 aa  184  8e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 178 aa  184  8e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  52.51 
 
 		 179 aa  183  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1559  ribosomal protein L6  55.31 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000979408  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  52.94 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  50.56 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4358  ribosomal protein L6  52.75 
 
 		 185 aa  181  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000653626  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 177 aa  181  6e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 178 aa  181  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  51.41 
 
 		 177 aa  180  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 180 aa  180  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  54.39 
 
 		 184 aa  179  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 176 aa  179  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  177  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  53.14 
 
 		 177 aa  177  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0617  ribosomal protein L6  51.65 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  51.7 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05795  50S ribosomal protein L6  51.38 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0681  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 180 aa  175  2e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  51.48 
 
 		 184 aa  175  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2604  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000953175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  49.73 
 
 		 187 aa  175  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 		 177 aa  174  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  175  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 		 179 aa  174  5e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1123  50S ribosomal protein L6  50.55 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.611465  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1146  ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 178 aa  174  6e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000104709  hitchhiker  0.00466337 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 179 aa  174  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  50 
 
 		 178 aa  174  7e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>