More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0305 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0305  50S ribosomal protein L6  100 
 
 
176 aa  352  2e-96  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.9924900000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  64.04 
 
 
178 aa  216  1e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  58.99 
 
 
178 aa  210  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  58.99 
 
 
178 aa  210  7e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  61.8 
 
 
178 aa  210  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  61.8 
 
 
178 aa  210  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  61.24 
 
 
178 aa  204  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 
178 aa  204  8e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  58.43 
 
 
178 aa  197  5e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  56.5 
 
 
177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  53.37 
 
 
178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  54.49 
 
 
179 aa  192  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  58.99 
 
 
178 aa  193  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1468  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 
178 aa  191  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 
179 aa  190  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 
179 aa  190  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 
179 aa  190  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 
179 aa  190  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 
179 aa  190  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 
179 aa  190  9e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 
179 aa  190  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 
179 aa  190  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 
179 aa  189  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 
179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  56.98 
 
 
179 aa  187  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 
177 aa  184  8e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  53.63 
 
 
179 aa  183  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00953  50S ribosomal protein L6  54.86 
 
 
177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0734749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  54.39 
 
 
183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 
179 aa  181  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  53.8 
 
 
182 aa  181  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 
178 aa  179  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  50.56 
 
 
178 aa  179  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 
177 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  53.93 
 
 
181 aa  179  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  51.7 
 
 
182 aa  177  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 
177 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 
177 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3428  50S ribosomal protein L6  52 
 
 
177 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  50.29 
 
 
177 aa  177  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  52.81 
 
 
180 aa  177  9e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  53.11 
 
 
179 aa  176  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3934  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 
177 aa  176  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 
179 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  54.12 
 
 
182 aa  175  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 
180 aa  176  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  51.98 
 
 
177 aa  176  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 
177 aa  175  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1636  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 
179 aa  175  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 
177 aa  175  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  53.37 
 
 
179 aa  175  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  52.87 
 
 
176 aa  175  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17511  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 
179 aa  174  4e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  51.41 
 
 
179 aa  174  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  51.12 
 
 
180 aa  174  6e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  49.44 
 
 
178 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 
179 aa  173  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 
180 aa  173  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  50.84 
 
 
180 aa  173  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  50 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0852  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115405  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1004  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00326754  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09000  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000131703  normal  0.1847 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  50 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  50.28 
 
 
177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 
177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  52.84 
 
 
178 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 
179 aa  171  6.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 
179 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 
179 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 
177 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 
177 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3053  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 
176 aa  170  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000512294  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 
177 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  52.57 
 
 
177 aa  170  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 
177 aa  169  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  50.29 
 
 
177 aa  169  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17351  50S ribosomal protein L6  47.75 
 
 
179 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1839  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 
178 aa  169  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  49.44 
 
 
178 aa  169  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  51.15 
 
 
176 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0282  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 
176 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00574931  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0352  50S ribosomal protein L6  51.43 
 
 
178 aa  169  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 
177 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0291  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 
176 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000875703  normal  0.0218003 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 
180 aa  168  3e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0185  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 
177 aa  168  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922994  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0163  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 
177 aa  168  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 
179 aa  168  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  53.14 
 
 
177 aa  168  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0342  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 
176 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0157965  normal  0.0125773 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 
179 aa  168  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2744  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 
176 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000130297  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 
177 aa  168  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0363  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 
176 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000934657  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0441  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 
177 aa  168  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296356  hitchhiker  0.000109216 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0420  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 
176 aa  168  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0146795  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 
177 aa  168  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.152453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>