More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2918 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  100 
 
 
183 aa  360  4e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  77.33 
 
 
183 aa  271  5.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  71.35 
 
 
182 aa  246  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  64.53 
 
 
182 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  64.61 
 
 
178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  64.13 
 
 
187 aa  231  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  62.92 
 
 
180 aa  231  5e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  62.36 
 
 
179 aa  230  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  62.36 
 
 
179 aa  230  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  62.36 
 
 
179 aa  230  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  62.36 
 
 
179 aa  230  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  62.36 
 
 
179 aa  230  7.000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  62.36 
 
 
179 aa  230  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  62.36 
 
 
179 aa  230  7.000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  62.36 
 
 
179 aa  230  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  64.61 
 
 
178 aa  230  9e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  63.89 
 
 
180 aa  229  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  62.36 
 
 
179 aa  229  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  61.24 
 
 
179 aa  227  6e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  61.24 
 
 
179 aa  227  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  62.3 
 
 
182 aa  226  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  61.8 
 
 
179 aa  225  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  63.37 
 
 
183 aa  218  5e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  58.99 
 
 
179 aa  217  6e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  59.44 
 
 
179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  55.98 
 
 
187 aa  213  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  58.99 
 
 
180 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  58.33 
 
 
180 aa  210  7e-54  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  59.44 
 
 
180 aa  210  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  61.05 
 
 
184 aa  208  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  58.89 
 
 
179 aa  208  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  59.44 
 
 
180 aa  205  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  56.18 
 
 
178 aa  203  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  54.35 
 
 
187 aa  202  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 
178 aa  201  6e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  57.3 
 
 
179 aa  199  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  58.33 
 
 
179 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  58.76 
 
 
181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  55.62 
 
 
178 aa  197  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 
178 aa  197  6e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 
178 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 
178 aa  195  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  55.11 
 
 
178 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  56.25 
 
 
177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  55 
 
 
179 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  59.41 
 
 
184 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 
178 aa  192  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  54.75 
 
 
179 aa  192  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  53.33 
 
 
179 aa  191  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  53.37 
 
 
177 aa  191  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 
178 aa  191  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0968  50S ribosomal protein L6  55.74 
 
 
184 aa  191  6e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.569336  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  56.67 
 
 
179 aa  191  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0681  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 
180 aa  190  8e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  53.37 
 
 
178 aa  190  9e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  56.11 
 
 
179 aa  190  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  54.19 
 
 
179 aa  189  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  54.19 
 
 
179 aa  190  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  55.06 
 
 
177 aa  189  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  55 
 
 
179 aa  189  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  54.49 
 
 
178 aa  189  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2892  ribosomal protein L6  54.49 
 
 
180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  54.19 
 
 
179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27601  Plastid ribosomal protein L6 large ribosomal subunit  55.37 
 
 
213 aa  188  4e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.935341  normal  0.110543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  55.56 
 
 
179 aa  188  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  53.26 
 
 
184 aa  188  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  52.51 
 
 
179 aa  188  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  52.81 
 
 
181 aa  187  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 
177 aa  186  1e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  57.22 
 
 
179 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  53.07 
 
 
179 aa  186  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0492  ribosomal protein L6  49.72 
 
 
178 aa  185  3e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187085  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  51.93 
 
 
179 aa  185  4e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  54.14 
 
 
180 aa  184  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  53.37 
 
 
177 aa  184  6e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0436  50S ribosomal protein L6P  53.41 
 
 
176 aa  184  8e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0157307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2604  50S ribosomal protein L6  53.33 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000953175  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 
179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  55 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  55 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  55 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  54.44 
 
 
180 aa  182  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 
177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 
178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  51.14 
 
 
177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  55 
 
 
180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  53.63 
 
 
179 aa  181  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  51.98 
 
 
177 aa  181  6e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  53.59 
 
 
180 aa  181  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  53.04 
 
 
180 aa  181  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  50 
 
 
177 aa  181  7e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0617  ribosomal protein L6  50.54 
 
 
185 aa  180  9.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  50.82 
 
 
184 aa  179  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 
177 aa  180  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  52.51 
 
 
179 aa  180  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  50.82 
 
 
184 aa  179  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 
179 aa  179  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 
179 aa  179  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>