More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0210 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 178 aa  352  1e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  69.1 
 
 		 178 aa  258  4e-68  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1468  50S ribosomal protein L6  64.04 
 
 		 178 aa  233  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  65.17 
 
 		 178 aa  229  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  64.04 
 
 		 178 aa  225  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  60.89 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  60.89 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  60.89 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  60.89 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  60.89 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  60.89 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  60.89 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  60.89 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  61.24 
 
 		 179 aa  213  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  60.34 
 
 		 179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  60.34 
 
 		 179 aa  210  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  61.24 
 
 		 178 aa  209  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0305  50S ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 176 aa  210  1e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.9924900000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  59.78 
 
 		 179 aa  207  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  57.87 
 
 		 180 aa  204  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 		 178 aa  204  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  57.87 
 
 		 178 aa  204  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  58.43 
 
 		 178 aa  203  1e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  59.55 
 
 		 178 aa  201  4e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  59.65 
 
 		 183 aa  200  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 179 aa  200  9e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  199  9.999999999999999e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  58.48 
 
 		 184 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  56.74 
 
 		 181 aa  194  8.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  54.12 
 
 		 182 aa  190  9e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  52.27 
 
 		 182 aa  190  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  54.39 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl138  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 180 aa  185  4e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  51.12 
 
 		 178 aa  184  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 181 aa  184  7e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  181  6e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 179 aa  180  9.000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  51.98 
 
 		 177 aa  180  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  54.86 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  54.07 
 
 		 183 aa  177  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  177  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  51.12 
 
 		 180 aa  177  7e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 178 aa  177  9e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  51.69 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4533  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000653047  normal  0.0640617 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  51.4 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  52.63 
 
 		 182 aa  175  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  175  4e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1307  50S ribosomal protein L6  50.55 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000236844  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  48.88 
 
 		 177 aa  174  5e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  51.38 
 
 		 180 aa  174  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  52.63 
 
 		 182 aa  174  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1379  50S ribosomal protein L6  50.55 
 
 		 184 aa  174  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  174  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 180 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4734  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000597715  normal  0.617382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0641  ribosomal protein L6  50.29 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000196267  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  49.16 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  48.04 
 
 		 180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0469  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000206818  hitchhiker  0.00000293736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0499  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  46.59 
 
 		 181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3894  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0502  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000123092  normal  0.096722 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  48.94 
 
 		 187 aa  171  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>