More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0240 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  100 
 
 		 181 aa  353  7.999999999999999e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  60.45 
 
 		 180 aa  224  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  60 
 
 		 182 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  58.52 
 
 		 182 aa  207  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  203  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 183 aa  197  7.999999999999999e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 179 aa  192  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  56.25 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  191  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  51.98 
 
 		 178 aa  190  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  53.22 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  54.24 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  56.25 
 
 		 179 aa  188  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  49.15 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  52.94 
 
 		 182 aa  184  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  52.27 
 
 		 181 aa  182  3e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 180 aa  182  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  54.12 
 
 		 184 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  49.72 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  180  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  52.05 
 
 		 183 aa  180  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  48.86 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  180  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  50.28 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  51.18 
 
 		 182 aa  179  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  48.89 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  53.8 
 
 		 183 aa  178  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 180 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  50.85 
 
 		 178 aa  177  4.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 178 aa  177  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  177  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 		 179 aa  177  9e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  53.59 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  177  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  50.83 
 
 		 181 aa  176  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 178 aa  176  2e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1241  50S ribosomal protein L6  50.83 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138167  hitchhiker  0.000825354 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2154  ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 176 aa  175  4e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0509532  normal  0.345883 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  50.56 
 
 		 179 aa  175  4e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 180 aa  174  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  47.22 
 
 		 180 aa  174  6e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  49.17 
 
 		 181 aa  174  6e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  49.71 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 179 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  45.45 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 		 179 aa  171  5e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  48.88 
 
 		 179 aa  171  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_431  ribosomal protein L6P/L9E  47.73 
 
 		 182 aa  171  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000303556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 187 aa  170  7.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  170  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 		 177 aa  170  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 178 aa  170  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1306  50S ribosomal protein L6  48.17 
 
 		 191 aa  169  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.629713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2203  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 		 177 aa  169  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0750089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2892  ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 180 aa  170  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  50.84 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>