More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2892 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2892  ribosomal protein L6  100 
 
 		 180 aa  357  6e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2604  50S ribosomal protein L6  72 
 
 		 179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000953175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1852  50S ribosomal protein L6  62.57 
 
 		 185 aa  227  7e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.668423 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  59.06 
 
 		 182 aa  202  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  54.8 
 
 		 178 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  55 
 
 		 180 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 178 aa  194  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 179 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  53.67 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  53.11 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 187 aa  192  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  55.29 
 
 		 182 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  54.44 
 
 		 180 aa  191  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 178 aa  190  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  190  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  190  9e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  190  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  187  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  53.93 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  53.48 
 
 		 187 aa  184  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 179 aa  184  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 179 aa  184  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 179 aa  184  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 178 aa  184  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 179 aa  183  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  51.12 
 
 		 179 aa  181  4.0000000000000006e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 178 aa  181  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  53.8 
 
 		 183 aa  180  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  53.85 
 
 		 184 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  50 
 
 		 179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  51.12 
 
 		 179 aa  178  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 180 aa  177  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 		 187 aa  178  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  50.28 
 
 		 177 aa  178  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  177  8e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  54.49 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  51.69 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  175  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 177 aa  175  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 178 aa  174  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  51.96 
 
 		 180 aa  174  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  50 
 
 		 181 aa  172  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  50.28 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  51.76 
 
 		 182 aa  171  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  53.22 
 
 		 183 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 179 aa  169  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  46.67 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  48.33 
 
 		 181 aa  170  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 181 aa  169  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1948  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 		 180 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0492  ribosomal protein L6  46.59 
 
 		 178 aa  168  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187085  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2033  50S ribosomal protein L6  47.78 
 
 		 180 aa  167  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.693671  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 		 179 aa  167  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 		 177 aa  167  8e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 		 177 aa  167  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 		 178 aa  167  9e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  49.44 
 
 		 179 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  48.02 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1931  50S ribosomal protein L6  47.75 
 
 		 180 aa  166  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  50.28 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  48 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  47.46 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>