More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23650 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  100 
 
 		 180 aa  353  6.999999999999999e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  72.78 
 
 		 179 aa  264  5.999999999999999e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  75 
 
 		 178 aa  263  8e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  72.22 
 
 		 179 aa  262  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  72.78 
 
 		 179 aa  260  8e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  72.78 
 
 		 179 aa  259  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  73.33 
 
 		 179 aa  255  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  68.89 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  69.44 
 
 		 179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  68.89 
 
 		 179 aa  251  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  69.44 
 
 		 180 aa  247  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  66.67 
 
 		 179 aa  246  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  67.78 
 
 		 180 aa  244  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  70.17 
 
 		 179 aa  244  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  67.78 
 
 		 178 aa  243  6.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  63.89 
 
 		 179 aa  240  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  64.44 
 
 		 179 aa  241  6e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  64.44 
 
 		 179 aa  240  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  66.67 
 
 		 178 aa  240  9e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  66.67 
 
 		 177 aa  239  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  63.89 
 
 		 179 aa  237  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  62.78 
 
 		 178 aa  238  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  65.56 
 
 		 180 aa  236  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  65 
 
 		 179 aa  234  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  66.3 
 
 		 178 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  63.89 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  63.89 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  63.89 
 
 		 179 aa  231  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  65.75 
 
 		 180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  62.98 
 
 		 180 aa  229  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  61.11 
 
 		 179 aa  229  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  62.78 
 
 		 178 aa  228  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  63.89 
 
 		 178 aa  227  9e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  60 
 
 		 178 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  61.67 
 
 		 178 aa  213  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  61.67 
 
 		 179 aa  210  9e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  57.22 
 
 		 180 aa  201  5e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  57.22 
 
 		 181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 177 aa  198  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  59.12 
 
 		 179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  187  7e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  56.67 
 
 		 179 aa  185  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  52.49 
 
 		 182 aa  184  4e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 179 aa  184  6e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 179 aa  184  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0730  ribosomal protein L6  53.22 
 
 		 184 aa  184  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  53.89 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  182  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 180 aa  181  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  50.85 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0492  ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 178 aa  177  8e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187085  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0266  ribosomal protein L6  52.51 
 
 		 179 aa  177  9e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  47.22 
 
 		 178 aa  176  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 178 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 178 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 187 aa  176  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 181 aa  177  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  52.94 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 		 177 aa  175  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  50.88 
 
 		 182 aa  175  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  48.89 
 
 		 180 aa  174  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  174  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  48.55 
 
 		 182 aa  174  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  52.22 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000224387 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  49.15 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2892  ribosomal protein L6  51.96 
 
 		 180 aa  174  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  52.78 
 
 		 179 aa  174  7e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  174  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  51.11 
 
 		 178 aa  174  8e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  174  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  53.18 
 
 		 182 aa  173  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 187 aa  173  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  52.51 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 179 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  51.67 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 		 179 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>