More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2751 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  100 
 
 		 177 aa  353  5e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4783  50S ribosomal protein L6  67.8 
 
 		 177 aa  246  8e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0251165  hitchhiker  0.0000000834141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0565  50S ribosomal protein L6  63.84 
 
 		 177 aa  244  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  66.67 
 
 		 177 aa  241  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1663  50S ribosomal protein L6  68.36 
 
 		 177 aa  240  6e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0799519  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  65.54 
 
 		 177 aa  240  7.999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1181  50S ribosomal protein L6  64.97 
 
 		 177 aa  238  4e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.238097  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1218  50S ribosomal protein L6  64.97 
 
 		 177 aa  238  4e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1971  50S ribosomal protein L6  64.97 
 
 		 177 aa  237  6.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000104023  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  66.1 
 
 		 177 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  67.23 
 
 		 177 aa  235  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  63.84 
 
 		 177 aa  234  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  63.28 
 
 		 177 aa  234  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1369  50S ribosomal protein L6  62.71 
 
 		 177 aa  233  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.622971  normal  0.0841779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0338  50S ribosomal protein L6  63.28 
 
 		 177 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1001  50S ribosomal protein L6  64.41 
 
 		 177 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372687  normal  0.0102466 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  66.1 
 
 		 177 aa  231  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1856  50S ribosomal protein L6  62.71 
 
 		 177 aa  231  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.789542  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  63.84 
 
 		 177 aa  230  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1923  50S ribosomal protein L6  63.28 
 
 		 177 aa  229  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591582  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0713  50S ribosomal protein L6  60.45 
 
 		 177 aa  229  1e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0735747  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  63.84 
 
 		 177 aa  229  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2464  50S ribosomal protein L6  62.71 
 
 		 177 aa  228  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2186  50S ribosomal protein L6  62.71 
 
 		 177 aa  228  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.788947 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1347  50S ribosomal protein L6  63.28 
 
 		 177 aa  227  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000134886  normal  0.277418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1445  50S ribosomal protein L6  63.28 
 
 		 177 aa  227  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.279932 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2149  50S ribosomal protein L6  62.15 
 
 		 177 aa  226  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  63.84 
 
 		 177 aa  223  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  61.58 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  60.45 
 
 		 177 aa  221  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0300  50S ribosomal protein L6  59.89 
 
 		 177 aa  221  4.9999999999999996e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  60.45 
 
 		 177 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2203  50S ribosomal protein L6  60.45 
 
 		 177 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0750089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 177 aa  216  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1730  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00717993  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0376  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.667963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 177 aa  211  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  210  1e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  57.63 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1931  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  58.19 
 
 		 177 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2981  50S ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2673  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  200  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711819  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  55.43 
 
 		 179 aa  198  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 177 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00745  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  197  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001727  LSU ribosomal protein L6p (L9e)  57.63 
 
 		 177 aa  197  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000194026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  197  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0294  50S ribosomal protein L6P  54.24 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000550047  hitchhiker  0.00000213592 
 
 
 
NC_009457  VC0395_A2159  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 177 aa  195  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302064  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  55.43 
 
 		 179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  57.39 
 
 		 179 aa  194  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  55.43 
 
 		 178 aa  193  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1004  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00326754  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  55.68 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  52.57 
 
 		 178 aa  191  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0436  50S ribosomal protein L6P  55.37 
 
 		 176 aa  192  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0157307  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0338  ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 175 aa  191  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 176 aa  191  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  55.11 
 
 		 179 aa  191  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  55.11 
 
 		 179 aa  190  8e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  57.14 
 
 		 179 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0335  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000240759  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3986  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0087686  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3807  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  52 
 
 		 178 aa  188  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  53.98 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  54.55 
 
 		 179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0782  ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  188  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000462697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2842  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 179 aa  187  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00681087  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  56.25 
 
 		 180 aa  187  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  50.86 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  53.98 
 
 		 179 aa  186  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  52 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000903619  hitchhiker  0.0000000381043 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  52 
 
 		 178 aa  185  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 		 177 aa  185  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  54.55 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  53.71 
 
 		 177 aa  185  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3323  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  184  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00060748  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  53.41 
 
 		 179 aa  184  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4529  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  184  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000152303  hitchhiker  0.000162155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  54.55 
 
 		 180 aa  184  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0163  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  184  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 178 aa  183  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  52.84 
 
 		 180 aa  183  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0065  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000654167  hitchhiker  0.0000000000000139653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  51.41 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00953  50S ribosomal protein L6  54.8 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0734749  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5064  50S ribosomal protein L6  53.67 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000965255  normal  0.133122 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0068  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00100116  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3899  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139368  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0185  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922994  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0598  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000013887  normal  0.735029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>