More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3147 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3147  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 184 aa  365  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.042273  normal  0.594052 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5772  ribosomal protein L6  70.11 
 
 		 185 aa  270  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245176  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4358  ribosomal protein L6  67.93 
 
 		 185 aa  256  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000653626  normal  0.128758 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0617  ribosomal protein L6  65.22 
 
 		 185 aa  247  9e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  61.96 
 
 		 184 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1630  ribosomal protein L6  61.96 
 
 		 184 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0182  50S ribosomal protein L6  61.96 
 
 		 184 aa  229  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.280256 
 
 
-
 
NC_002950  PG1923  50S ribosomal protein L6  57.61 
 
 		 183 aa  215  2e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05795  50S ribosomal protein L6  57.69 
 
 		 180 aa  211  5.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0382  50S ribosomal protein L6  57.69 
 
 		 180 aa  206  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95579  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1162  50S ribosomal protein L6  57.69 
 
 		 180 aa  201  5e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000404659  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  48.65 
 
 		 180 aa  185  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1570  ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 179 aa  185  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.362443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  52.2 
 
 		 178 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  51.09 
 
 		 179 aa  181  7e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  48.91 
 
 		 179 aa  180  8.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  49.73 
 
 		 179 aa  177  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  49.73 
 
 		 179 aa  177  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  46.2 
 
 		 181 aa  177  7e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  47.28 
 
 		 179 aa  177  7e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  51.1 
 
 		 178 aa  177  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  51.1 
 
 		 178 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  47.83 
 
 		 187 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  50.83 
 
 		 178 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  47.57 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  48.09 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000333726  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  49.45 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  47.54 
 
 		 179 aa  174  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000514634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  47.8 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  47.83 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  47.83 
 
 		 179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  48.35 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  49.45 
 
 		 180 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  48.39 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  49.73 
 
 		 179 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 180 aa  170  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  51.09 
 
 		 180 aa  170  9e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  47.8 
 
 		 178 aa  170  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  48.09 
 
 		 178 aa  170  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  47.54 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  48.39 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  50.82 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  46.74 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  48.35 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  46.2 
 
 		 179 aa  168  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  44.94 
 
 		 182 aa  168  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  47.51 
 
 		 179 aa  167  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 179 aa  167  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  45.79 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 179 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  50 
 
 		 179 aa  166  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  49.19 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  47.83 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  47.31 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  45.9 
 
 		 178 aa  166  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  48.9 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  46.2 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  42.93 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 179 aa  165  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  47.8 
 
 		 178 aa  165  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  47.54 
 
 		 179 aa  165  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  49.46 
 
 		 179 aa  164  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  46.74 
 
 		 179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  48.3 
 
 		 183 aa  164  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  44.57 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  46.67 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  47.28 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0681  50S ribosomal protein L6  46.74 
 
 		 180 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  46.45 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  45.26 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  45.36 
 
 		 180 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  45.45 
 
 		 180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  44.02 
 
 		 180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  46.74 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  47.16 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  44.32 
 
 		 180 aa  159  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  45.11 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  47.28 
 
 		 180 aa  159  2e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2519  50S ribosomal protein L6  46.67 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  42.93 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0606  50S ribosomal protein L6  48.62 
 
 		 177 aa  159  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 		 183 aa  158  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  48.37 
 
 		 179 aa  157  6e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  44.2 
 
 		 179 aa  157  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  44.02 
 
 		 181 aa  157  8e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  44.32 
 
 		 180 aa  156  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>