29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3034 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3034  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 280 aa  499  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169142  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1787  hypothetical protein  49.1 
 
 		 278 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1659  hypothetical protein  42.05 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5122  hypothetical protein  44.6 
 
 		 278 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0524  hypothetical protein  35.54 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2771  hypothetical protein  45.9 
 
 		 278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.124802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4445  hypothetical protein  42.7 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2961  hypothetical protein  42.55 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.269655  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2816  hypothetical protein  40.07 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.799492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3525  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.24 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1383  hypothetical protein  37.99 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.263391  normal  0.488551 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1639  hypothetical protein  42.54 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1585  hypothetical protein  42.54 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.442121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1614  hypothetical protein  42.54 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.78 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1921  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.13 
 
 		 279 aa  92.8  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1917  hypothetical protein  41.44 
 
 		 259 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2999  hypothetical protein  34.94 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0318542  normal  0.330569 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.808644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.73 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0898  hypothetical protein  30.63 
 
 		 288 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0731  hypothetical protein  30.63 
 
 		 288 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0717  hypothetical protein  30.63 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2444  hypothetical protein  30.28 
 
 		 288 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2364  hypothetical protein  30.28 
 
 		 288 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2714  hypothetical protein  30.28 
 
 		 288 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0232  hypothetical protein  30.28 
 
 		 288 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36922  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 276 aa  48.9  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0841167  normal  0.892969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3545  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.59 
 
 		 279 aa  45.8  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0409938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>