21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2999 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2999  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  524  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0318542  normal  0.330569 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1659  hypothetical protein  40.07 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2816  hypothetical protein  45.8 
 
 
279 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.799492  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0524  hypothetical protein  36.82 
 
 
285 aa  159  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1383  hypothetical protein  37.5 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.263391  normal  0.488551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2961  hypothetical protein  37.12 
 
 
275 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.269655  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1787  hypothetical protein  36.93 
 
 
278 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156109  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5122  hypothetical protein  33.22 
 
 
278 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2771  hypothetical protein  34.72 
 
 
278 aa  93.2  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.124802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4445  hypothetical protein  31.65 
 
 
276 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.66 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3525  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.55 
 
 
275 aa  75.5  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.97 
 
 
280 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1917  hypothetical protein  33.08 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622531  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1921  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281537  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.51 
 
 
296 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.808644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1585  hypothetical protein  33.78 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.442121  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1614  hypothetical protein  33.78 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1639  hypothetical protein  33.78 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0914  hypothetical protein  29.43 
 
 
289 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.684229 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.59 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>