27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3525 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3525  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 275 aa  501  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1787  hypothetical protein  43.77 
 
 		 278 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1383  hypothetical protein  39.79 
 
 		 283 aa  133  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.263391  normal  0.488551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1921  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.93 
 
 		 279 aa  102  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2771  hypothetical protein  39.08 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.124802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5122  hypothetical protein  39.85 
 
 		 278 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4445  hypothetical protein  38.15 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2816  hypothetical protein  33.58 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.799492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1659  hypothetical protein  33.08 
 
 		 281 aa  96.7  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.69 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.81 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.808644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1614  hypothetical protein  37 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1639  hypothetical protein  37 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1585  hypothetical protein  37 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.442121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.97 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0524  hypothetical protein  25.55 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2961  hypothetical protein  33.21 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.269655  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1917  hypothetical protein  35.78 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3545  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.53 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0409938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3034  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.31 
 
 		 280 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169142  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2999  hypothetical protein  29.77 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0318542  normal  0.330569 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.02 
 
 		 320 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1340  hypothetical protein  31.68 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0914  hypothetical protein  24.73 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.684229 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.85 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  39.44 
 
 		 145 aa  43.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.95 
 
 		 330 aa  42.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>