42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2961 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2961  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  511  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.269655  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4445  hypothetical protein  38.04 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1787  hypothetical protein  38.69 
 
 
278 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156109  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2816  hypothetical protein  39.93 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.799492  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1659  hypothetical protein  35.63 
 
 
281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0524  hypothetical protein  31.9 
 
 
285 aa  113  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5122  hypothetical protein  37.55 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2771  hypothetical protein  37.31 
 
 
278 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.124802 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2999  hypothetical protein  35.32 
 
 
283 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0318542  normal  0.330569 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1639  hypothetical protein  39.74 
 
 
249 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1585  hypothetical protein  39.74 
 
 
249 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.442121  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1614  hypothetical protein  39.74 
 
 
249 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.23 
 
 
344 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1383  hypothetical protein  33.79 
 
 
283 aa  92.8  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.263391  normal  0.488551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1921  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.09 
 
 
279 aa  92.4  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281537  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1917  hypothetical protein  37.55 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622531  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.71 
 
 
296 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.808644 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3525  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.74 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3034  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.84 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169142  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.23 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  40.4 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  40.4 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  40.4 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  40.4 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  36.73 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  36.73 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  43.21 
 
 
356 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  43.21 
 
 
356 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  43.21 
 
 
356 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  43.21 
 
 
356 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  43.21 
 
 
356 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  43.21 
 
 
353 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  43.21 
 
 
356 aa  43.5  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0731  hypothetical protein  36.31 
 
 
288 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0898  hypothetical protein  36.31 
 
 
288 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2444  hypothetical protein  36.31 
 
 
288 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4923  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.78 
 
 
137 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.137269 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2364  hypothetical protein  36.31 
 
 
288 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2714  hypothetical protein  36.31 
 
 
288 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0232  hypothetical protein  36.31 
 
 
288 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0717  hypothetical protein  36.31 
 
 
288 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  41.98 
 
 
402 aa  42  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>