21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1015 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
296 aa  542  1e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.808644 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1787  hypothetical protein  39.46 
 
 
278 aa  135  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156109  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0524  hypothetical protein  32.18 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2771  hypothetical protein  36.13 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.124802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1659  hypothetical protein  31.18 
 
 
281 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4445  hypothetical protein  37.28 
 
 
276 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1383  hypothetical protein  35.08 
 
 
283 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.263391  normal  0.488551 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2816  hypothetical protein  36.3 
 
 
279 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.799492  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2961  hypothetical protein  35.71 
 
 
275 aa  92.4  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.269655  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5122  hypothetical protein  34.84 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1639  hypothetical protein  34.48 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1585  hypothetical protein  34.48 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.442121  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1614  hypothetical protein  34.48 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.62 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1921  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.13 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281537  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1917  hypothetical protein  32.94 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622531  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3525  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.75 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.83 
 
 
280 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2999  hypothetical protein  29.12 
 
 
283 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0318542  normal  0.330569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  35.21 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.34 
 
 
298 aa  43.5  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>