34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4933 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
344 aa  644    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1787  hypothetical protein  39.88 
 
 
278 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156109  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1383  hypothetical protein  34.97 
 
 
283 aa  116  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.263391  normal  0.488551 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0524  hypothetical protein  32.08 
 
 
285 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4445  hypothetical protein  40.64 
 
 
276 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1659  hypothetical protein  35.78 
 
 
281 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1921  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.91 
 
 
279 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281537  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2816  hypothetical protein  39.06 
 
 
279 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.799492  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1614  hypothetical protein  32.06 
 
 
249 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1639  hypothetical protein  32.06 
 
 
249 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1585  hypothetical protein  32.06 
 
 
249 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.442121  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5122  hypothetical protein  38.46 
 
 
278 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2961  hypothetical protein  39.89 
 
 
275 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.269655  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2771  hypothetical protein  33.33 
 
 
278 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.124802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3525  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.06 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2999  hypothetical protein  34.74 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0318542  normal  0.330569 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.61 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.808644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1917  hypothetical protein  38.29 
 
 
259 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622531  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3545  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.63 
 
 
279 aa  52  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0409938  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3034  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.4 
 
 
280 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169142  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0898  hypothetical protein  33.7 
 
 
288 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0731  hypothetical protein  33.7 
 
 
288 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2444  hypothetical protein  33.15 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0717  hypothetical protein  33.7 
 
 
288 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2364  hypothetical protein  33.15 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2714  hypothetical protein  33.15 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0232  hypothetical protein  33.15 
 
 
288 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36922  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.94 
 
 
280 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1083  hypothetical protein  27.05 
 
 
137 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.459901  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  46.55 
 
 
251 aa  43.1  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  38.95 
 
 
301 aa  42.7  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1340  hypothetical protein  28.77 
 
 
280 aa  42.7  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  40.21 
 
 
309 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  40.21 
 
 
309 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>