37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3545 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3545  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 279 aa  501  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0409938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1383  hypothetical protein  49.65 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.263391  normal  0.488551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1921  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.21 
 
 		 279 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3525  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.49 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1787  hypothetical protein  37.63 
 
 		 278 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1659  hypothetical protein  35.77 
 
 		 281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.22 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2771  hypothetical protein  40.61 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.124802 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2816  hypothetical protein  37.41 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.799492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0524  hypothetical protein  28.85 
 
 		 285 aa  85.9  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2961  hypothetical protein  40.82 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.269655  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0914  hypothetical protein  29.9 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.684229 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0717  hypothetical protein  34.62 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.511589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2444  hypothetical protein  34.27 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2714  hypothetical protein  34.27 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0232  hypothetical protein  34.27 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.36922  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2364  hypothetical protein  34.27 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0731  hypothetical protein  34.27 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0898  hypothetical protein  34.27 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.4 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.808644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5122  hypothetical protein  35.42 
 
 		 278 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4445  hypothetical protein  33.08 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60 
 
 		 344 aa  52.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1585  hypothetical protein  31.82 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.442121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1614  hypothetical protein  31.82 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1639  hypothetical protein  31.82 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.35 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3034  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.5 
 
 		 280 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169142  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1883  hypothetical protein  32.47 
 
 		 310 aa  45.8  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00906285  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2999  hypothetical protein  29.21 
 
 		 283 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0318542  normal  0.330569 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  38.37 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  38.37 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1340  hypothetical protein  31.16 
 
 		 280 aa  42.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  38.37 
 
 		 309 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  38.37 
 
 		 309 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  38.37 
 
 		 309 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  38.37 
 
 		 309 aa  42.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>