21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5122 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5122  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  510  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1787  hypothetical protein  41.67 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156109  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4445  hypothetical protein  38.46 
 
 
276 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2771  hypothetical protein  40.6 
 
 
278 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.124802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1659  hypothetical protein  31.97 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1639  hypothetical protein  39.65 
 
 
249 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1585  hypothetical protein  39.65 
 
 
249 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.442121  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1614  hypothetical protein  39.65 
 
 
249 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0524  hypothetical protein  29.02 
 
 
285 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3525  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.68 
 
 
275 aa  102  9e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2961  hypothetical protein  36.98 
 
 
275 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.269655  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1917  hypothetical protein  38.91 
 
 
259 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622531  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1383  hypothetical protein  35.61 
 
 
283 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.263391  normal  0.488551 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2816  hypothetical protein  35.71 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.799492  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.74 
 
 
344 aa  95.5  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2999  hypothetical protein  32.45 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0318542  normal  0.330569 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.19 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.808644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1921  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.96 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.281537  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3034  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.31 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169142  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.08 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3783  DMT family permease  36.05 
 
 
158 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410405  normal  0.488499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>