97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4312 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  275  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  68.75 
 
 
144 aa  205  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  70.34 
 
 
145 aa  189  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  59.72 
 
 
145 aa  178  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  69.23 
 
 
143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  69.23 
 
 
143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  69.23 
 
 
143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  61.59 
 
 
143 aa  176  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.59 
 
 
143 aa  175  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  61.15 
 
 
140 aa  174  4e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  61.15 
 
 
141 aa  170  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  61.15 
 
 
142 aa  170  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  59.71 
 
 
142 aa  168  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  57.14 
 
 
146 aa  163  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.52 
 
 
145 aa  152  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  56.52 
 
 
145 aa  152  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  59.71 
 
 
146 aa  153  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  58.39 
 
 
144 aa  151  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.83 
 
 
145 aa  150  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.8 
 
 
145 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.56 
 
 
146 aa  148  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.55 
 
 
145 aa  147  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.42 
 
 
145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  53.47 
 
 
145 aa  142  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  63.85 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  61.15 
 
 
142 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  62.7 
 
 
141 aa  132  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  61.15 
 
 
142 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  49.28 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.03 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  45.59 
 
 
137 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  44.85 
 
 
138 aa  120  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  53.28 
 
 
145 aa  120  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.01 
 
 
138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.32 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.12 
 
 
144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.76 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  39.86 
 
 
293 aa  110  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  41.43 
 
 
142 aa  104  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.06 
 
 
137 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40 
 
 
142 aa  100  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.79 
 
 
137 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.86 
 
 
287 aa  97.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.57 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.3 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  39.42 
 
 
139 aa  93.6  9e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.67 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  41.91 
 
 
142 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  41.91 
 
 
142 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  41.91 
 
 
142 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  41.91 
 
 
142 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  41.91 
 
 
142 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  41.18 
 
 
142 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  41.91 
 
 
142 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  41.91 
 
 
142 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  40.44 
 
 
142 aa  88.2  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  41.18 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  41.18 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.71 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  38.1 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  40 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  40 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  39.29 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.26 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.06 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.68 
 
 
284 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.797294  normal  0.0204425 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  31.82 
 
 
303 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0404  hypothetical protein  35.53 
 
 
327 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.92172  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.11 
 
 
298 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1831  hypothetical protein  35.53 
 
 
356 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4025  hypothetical protein  33.04 
 
 
274 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.651718  normal  0.814245 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  38.6 
 
 
293 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1474  hypothetical protein  35.53 
 
 
277 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  40.35 
 
 
278 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3525  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.44 
 
 
275 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1325  hypothetical protein  38.6 
 
 
306 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0356003  normal  0.196429 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0501  hypothetical protein  35.53 
 
 
277 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.777031  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0818  hypothetical protein  35.53 
 
 
354 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4826  hypothetical protein  30.14 
 
 
307 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2134  hypothetical protein  35.53 
 
 
354 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00423  predicted permease, DMT superfamily protein  31.58 
 
 
294 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  27.84 
 
 
306 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  34.95 
 
 
290 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0880  hypothetical protein  25.18 
 
 
307 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.93 
 
 
355 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  28.05 
 
 
273 aa  41.6  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  38.6 
 
 
278 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  38.6 
 
 
278 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  38.6 
 
 
278 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0080  RarD protein, DMT superfamily transporter  32.35 
 
 
292 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  35.09 
 
 
345 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.18 
 
 
291 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926572 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  36.99 
 
 
290 aa  40.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  36 
 
 
280 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  36.99 
 
 
290 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.56 
 
 
320 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>