91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1304 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  275  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  272  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  95.07 
 
 		 142 aa  265  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  65.96 
 
 		 145 aa  183  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4563  hypothetical protein  68.09 
 
 		 145 aa  178  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2296  hypothetical protein  62.04 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0939818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5645  hypothetical protein  64.03 
 
 		 146 aa  174  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1410  integral membrane protein  62.86 
 
 		 140 aa  173  8e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3005  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.12 
 
 		 145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4312  hypothetical protein  61.15 
 
 		 145 aa  170  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4058  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.25 
 
 		 145 aa  168  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.344241  normal  0.452833 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0103  hypothetical protein  66.42 
 
 		 144 aa  166  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0476  hypothetical protein  67.63 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1757  hypothetical protein  70.31 
 
 		 141 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0344568  normal  0.0517722 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3491  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.03 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4036  hypothetical protein  57.55 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513536  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0799  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.42 
 
 		 145 aa  157  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0780249  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0839  hypothetical protein  59.42 
 
 		 145 aa  157  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.168462  normal  0.579461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2587  hypothetical protein  60.29 
 
 		 143 aa  156  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.46521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3006  hypothetical protein  63.31 
 
 		 143 aa  156  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0319253 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4041  hypothetical protein  63.31 
 
 		 143 aa  156  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.579736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4976  hypothetical protein  63.31 
 
 		 143 aa  156  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.379016  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0762  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.45 
 
 		 145 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.363429  normal  0.0593189 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4283  hypothetical protein  65.62 
 
 		 145 aa  150  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0785264 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.18 
 
 		 146 aa  147  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.77 
 
 		 145 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6234  hypothetical protein  62.41 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71880  hypothetical protein  63.12 
 
 		 142 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  58.27 
 
 		 145 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2739  hypothetical protein  51.47 
 
 		 138 aa  130  6.999999999999999e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00174572  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1399  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  50 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.126576  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1494  hypothetical protein  46.76 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.140947  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1234  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.92 
 
 		 138 aa  120  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2870  hypothetical protein  45.99 
 
 		 293 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000020222  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1628  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.65 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000213352  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3359  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.59 
 
 		 137 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  normal  0.349029 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0514  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.85 
 
 		 144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000118881  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2541  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.78 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1213  hypothetical protein  44.68 
 
 		 142 aa  107  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00065013  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2889  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.44 
 
 		 137 aa  105  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.853447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.5 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1078  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.44 
 
 		 137 aa  104  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3118  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.26 
 
 		 142 aa  103  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0186  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.01 
 
 		 287 aa  102  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000405902  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1170  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.86 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0396  hypothetical protein  40.71 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0531  EamA family protein  40 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6733  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.17 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.613409 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0462  transporter, EamA family  40 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0532  transporter, EamA family  40 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0416  eama family protein  40 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0404  EamA family protein  40 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0403  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0395  DMT family permease  40 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0391  DMT family permease  40 
 
 		 142 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6961  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.53 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.915321  normal  0.0744442 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4842  transporter, EamA family  38.57 
 
 		 142 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0481  transporter, EamA family  38.57 
 
 		 142 aa  90.5  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3577  hypothetical protein  42.55 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.019406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1101  integral membrane protein  42.55 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000297409  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1154  hypothetical protein  41.84 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104519  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1124  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.84 
 
 		 142 aa  87.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00709741  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0568  hypothetical protein  38.21 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.134019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.55 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1192  hypothetical protein  37.32 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.89 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3481  permease  32.93 
 
 		 273 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  28.68 
 
 		 300 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2320  hypothetical protein  34.88 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.384685  normal  0.0277976 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  27.94 
 
 		 302 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  27.94 
 
 		 302 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  28.68 
 
 		 289 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1323  hypothetical protein  25.76 
 
 		 291 aa  43.5  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000201955  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  28.26 
 
 		 300 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  28.8 
 
 		 297 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0999  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.24 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  28.68 
 
 		 300 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  30.4 
 
 		 297 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  27.94 
 
 		 302 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  31.25 
 
 		 290 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  29.41 
 
 		 274 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  32.33 
 
 		 303 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  23.68 
 
 		 305 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  32.26 
 
 		 290 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  32.91 
 
 		 275 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0359  hypothetical protein  29.89 
 
 		 278 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07550  drug/metabolite transporter (dmt superfamily)  27.5 
 
 		 269 aa  40.8  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2141  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.03 
 
 		 327 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.735788  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1359  hypothetical protein  30.48 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  35.82 
 
 		 319 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2477  hypothetical protein  27.21 
 
 		 121 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373753 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>