97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4978 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  601  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3975  hypothetical protein  69.51 
 
 
312 aa  419  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3352  membrane protein  46.71 
 
 
311 aa  249  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4094  hypothetical protein  44.74 
 
 
319 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1686  hypothetical protein  46.51 
 
 
328 aa  231  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.658717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3663  hypothetical protein  45.72 
 
 
319 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1753  hypothetical protein  44.08 
 
 
324 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3961  hypothetical protein  44.52 
 
 
324 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.761458  normal  0.0378456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1345  hypothetical protein  44.85 
 
 
320 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0815858  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1729  hypothetical protein  44.74 
 
 
320 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1361  hypothetical protein  45.85 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00507818  normal  0.397175 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0560  hypothetical protein  39.1 
 
 
320 aa  195  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00477006  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3610  integral membrane protein  38.06 
 
 
328 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000195591  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.75 
 
 
314 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000192809  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3755  hypothetical protein  38.06 
 
 
328 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000395481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3976  hypothetical protein  38.06 
 
 
312 aa  193  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000242668  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0795  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.1 
 
 
320 aa  193  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.93 
 
 
306 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00208172  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0475  hypothetical protein  37.72 
 
 
334 aa  189  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164528  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3620  hypothetical protein  37.25 
 
 
321 aa  189  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000693359  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0247  hypothetical protein  36.61 
 
 
306 aa  186  6e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00278162  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3492  putative transporter  36.58 
 
 
321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3494  putative transporter  36.58 
 
 
321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00919199  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3599  putative transporter  36.58 
 
 
321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0879234  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3563  putative transporter  36.58 
 
 
321 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03049  conserved inner membrane protein  36.24 
 
 
321 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00601022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3377  putative transporter  36.24 
 
 
321 aa  181  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.82024e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3669  putative transporter  36.24 
 
 
321 aa  181  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000521429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03000  hypothetical protein  36.24 
 
 
321 aa  181  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00567967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0516  hypothetical protein  36.24 
 
 
321 aa  181  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000278585  hitchhiker  0.00919443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3480  putative transporter  36.24 
 
 
321 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000496501  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.24 
 
 
321 aa  181  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000715039  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3586  putative transporter  36.24 
 
 
321 aa  179  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000241  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4506  putative transporter  36.24 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000436684  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3427  hypothetical protein  34.58 
 
 
329 aa  165  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3601  hypothetical protein  34.58 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0565  hypothetical protein  36.02 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0525  hypothetical protein  34.24 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0634  hypothetical protein  33.22 
 
 
339 aa  162  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4040  integral membrane domain-containing protein  34.24 
 
 
349 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0579  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 
324 aa  159  6e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0549  hypothetical protein  33.11 
 
 
324 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3761  hypothetical protein  33.68 
 
 
324 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0573  hypothetical protein  33.68 
 
 
324 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0498  integral membrane domain-containing protein  33 
 
 
316 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3715  hypothetical protein  35.79 
 
 
322 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4064  hypothetical protein  35.55 
 
 
321 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0631  hypothetical protein  35.36 
 
 
320 aa  143  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.789426 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  26.02 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.37 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  25.39 
 
 
299 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  21.85 
 
 
307 aa  49.3  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  26.6 
 
 
304 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.36 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1565  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.28 
 
 
146 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365601 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  25.25 
 
 
309 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  26.47 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.81 
 
 
306 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0298  hypothetical protein  24.36 
 
 
297 aa  46.6  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  24.31 
 
 
289 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  23.98 
 
 
286 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  24.07 
 
 
286 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  25 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.22 
 
 
355 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24.75 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  24.24 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 
286 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  25.88 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  25 
 
 
312 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  35.29 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0936  rarD protein  27.27 
 
 
295 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1604  hypothetical protein  26.92 
 
 
302 aa  45.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.72 
 
 
314 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  25.66 
 
 
300 aa  43.9  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.44 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.943556  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.72 
 
 
315 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  26.91 
 
 
325 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.39 
 
 
291 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7598  hypothetical protein  23.78 
 
 
145 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.182206 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.42 
 
 
306 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.4 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 
295 aa  43.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  33.82 
 
 
295 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  33.82 
 
 
294 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  23.08 
 
 
289 aa  42.7  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  33.82 
 
 
294 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1678  hypothetical protein  24.75 
 
 
355 aa  42.7  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000385803 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  33.82 
 
 
294 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 
320 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  33.82 
 
 
294 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  33.82 
 
 
294 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.67 
 
 
316 aa  42.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.84 
 
 
287 aa  42.4  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0463  hypothetical protein  23.92 
 
 
289 aa  42.4  0.01  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  26.06 
 
 
300 aa  42.4  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  21.74 
 
 
305 aa  42.4  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>