81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1729 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1729  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  617  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3663  hypothetical protein  94.65 
 
 		 319 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4094  hypothetical protein  79.11 
 
 		 319 aa  498  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1345  hypothetical protein  78.12 
 
 		 320 aa  474  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0815858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3961  hypothetical protein  77.46 
 
 		 324 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.761458  normal  0.0378456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1753  hypothetical protein  76.51 
 
 		 324 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1361  hypothetical protein  80.25 
 
 		 320 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00507818  normal  0.397175 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1686  hypothetical protein  72.78 
 
 		 328 aa  441  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.658717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3352  membrane protein  48.37 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3975  hypothetical protein  44.81 
 
 		 312 aa  231  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  44.74 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0795  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.86 
 
 		 320 aa  229  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3755  hypothetical protein  43.69 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000395481  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0560  hypothetical protein  42.86 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00477006  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3610  integral membrane protein  43.69 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000195591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3976  hypothetical protein  43.69 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000242668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.9 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000192809  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0516  hypothetical protein  43.87 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000278585  hitchhiker  0.00919443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3480  putative transporter  43.87 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000496501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03000  hypothetical protein  43.87 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00567967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3669  putative transporter  43.87 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000521429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3377  putative transporter  43.87 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.82024e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.87 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000715039  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03049  conserved inner membrane protein  43.87 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00601022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3586  putative transporter  43.55 
 
 		 321 aa  223  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000241  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.1 
 
 		 306 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00208172  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3492  putative transporter  41.94 
 
 		 321 aa  221  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543428  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3563  putative transporter  41.94 
 
 		 321 aa  221  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3494  putative transporter  41.94 
 
 		 321 aa  221  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00919199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3599  putative transporter  41.94 
 
 		 321 aa  221  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0879234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4506  putative transporter  43.87 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000436684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3620  hypothetical protein  42.48 
 
 		 321 aa  216  5e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000693359  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0475  hypothetical protein  40.65 
 
 		 334 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0247  hypothetical protein  38.93 
 
 		 306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00278162  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4064  hypothetical protein  33.23 
 
 		 321 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3427  hypothetical protein  33.55 
 
 		 329 aa  145  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3601  hypothetical protein  33.55 
 
 		 329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0525  hypothetical protein  33.55 
 
 		 329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4040  integral membrane domain-containing protein  33.55 
 
 		 349 aa  144  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0579  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.38 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0549  hypothetical protein  32.37 
 
 		 324 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3761  hypothetical protein  32.27 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0573  hypothetical protein  32.27 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0634  hypothetical protein  31.75 
 
 		 339 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0498  integral membrane domain-containing protein  33.66 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0565  hypothetical protein  30.79 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0631  hypothetical protein  32.35 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.789426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3715  hypothetical protein  31.17 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  25.1 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  25.5 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  25.1 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  25 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.69 
 
 		 303 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.27 
 
 		 305 aa  52.8  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  26.15 
 
 		 312 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  23.2 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.77 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  23.55 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  28.35 
 
 		 294 aa  49.7  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  24.74 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  30.64 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  23.88 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  22.78 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.6 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4320  hypothetical protein  25.44 
 
 		 219 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  21.76 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  23.55 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.7 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  25.84 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  23.55 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  27.78 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  24.52 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  23.55 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.8 
 
 		 305 aa  43.9  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  29.55 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  26.29 
 
 		 328 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  30.08 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  24.35 
 
 		 314 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  27.11 
 
 		 286 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  27.13 
 
 		 307 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2406  DMT family permease  24.1 
 
 		 304 aa  42.7  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>