96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1753 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1753  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3961  hypothetical protein  98.46 
 
 		 324 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.761458  normal  0.0378456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1345  hypothetical protein  94.6 
 
 		 320 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0815858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1361  hypothetical protein  91.43 
 
 		 320 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00507818  normal  0.397175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4094  hypothetical protein  76.83 
 
 		 319 aa  480  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1729  hypothetical protein  76.51 
 
 		 320 aa  462  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3663  hypothetical protein  73.98 
 
 		 319 aa  454  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1686  hypothetical protein  73.08 
 
 		 328 aa  431  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.658717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3352  membrane protein  49.02 
 
 		 311 aa  262  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3975  hypothetical protein  44.74 
 
 		 312 aa  240  2.9999999999999997e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  44.08 
 
 		 305 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3755  hypothetical protein  42.86 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000395481  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3610  integral membrane protein  42.86 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000195591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3976  hypothetical protein  42.04 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000242668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3492  putative transporter  43.05 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3494  putative transporter  43.05 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00919199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3599  putative transporter  43.05 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0879234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3563  putative transporter  43.05 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0795  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.3 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0560  hypothetical protein  42.19 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00477006  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.81 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00208172  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.05 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000715039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3377  putative transporter  43.05 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.82024e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3669  putative transporter  43.05 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000521429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03000  hypothetical protein  43.05 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00567967  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0516  hypothetical protein  43.05 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000278585  hitchhiker  0.00919443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3480  putative transporter  43.05 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000496501  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03049  conserved inner membrane protein  43.05 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00601022  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3620  hypothetical protein  42.16 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000693359  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.91 
 
 		 314 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000192809  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3586  putative transporter  42.37 
 
 		 321 aa  209  5e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000241  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4506  putative transporter  43.39 
 
 		 321 aa  206  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000436684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0475  hypothetical protein  40.26 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0247  hypothetical protein  37.58 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00278162  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4064  hypothetical protein  31.79 
 
 		 321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4040  integral membrane domain-containing protein  33.55 
 
 		 349 aa  144  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3601  hypothetical protein  32.69 
 
 		 329 aa  143  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3427  hypothetical protein  33.01 
 
 		 329 aa  142  8e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0525  hypothetical protein  33.22 
 
 		 329 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0579  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.58 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0573  hypothetical protein  32.58 
 
 		 324 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3761  hypothetical protein  32.58 
 
 		 324 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0549  hypothetical protein  32.58 
 
 		 324 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0634  hypothetical protein  32.6 
 
 		 339 aa  135  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0498  integral membrane domain-containing protein  34.41 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0631  hypothetical protein  31.21 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.789426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3715  hypothetical protein  31.51 
 
 		 322 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0565  hypothetical protein  29.87 
 
 		 325 aa  125  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  26.55 
 
 		 309 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  26.74 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  26.37 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  26.55 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  31.52 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  29.53 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.943556  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  26.46 
 
 		 312 aa  52.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  28.52 
 
 		 308 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  24.74 
 
 		 303 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  31.03 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4320  hypothetical protein  25.73 
 
 		 219 aa  49.7  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.73 
 
 		 303 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  28.62 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  28 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.56 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  21.34 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  22.87 
 
 		 303 aa  47  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.21 
 
 		 305 aa  47  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  20.63 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0829  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.41 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.412123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  23.3 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  23.24 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1985  hypothetical protein  37.78 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  25.28 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0230  hypothetical protein  37.78 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1569  hypothetical protein  37.78 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.051937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1128  hypothetical protein  37.78 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.108059  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.15 
 
 		 305 aa  44.3  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  24.74 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2142  putative transmembrane protein  37.78 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0704915  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.06 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2006  mtultidrug ABC transporter permease  37.78 
 
 		 236 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  28.15 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  28.15 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  25.93 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.94 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.503688 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  28.15 
 
 		 301 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  25.93 
 
 		 294 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  29.88 
 
 		 286 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1972  hypothetical protein  25 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  25.93 
 
 		 294 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0244  hypothetical protein  25.15 
 
 		 310 aa  43.5  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  25.93 
 
 		 294 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  25.93 
 
 		 294 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 		 286 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  28.87 
 
 		 286 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>