87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3663 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3663  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1729  hypothetical protein  94.65 
 
 		 320 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4094  hypothetical protein  78.16 
 
 		 319 aa  488  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1345  hypothetical protein  76.1 
 
 		 320 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0815858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3961  hypothetical protein  74.61 
 
 		 324 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.761458  normal  0.0378456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1753  hypothetical protein  73.98 
 
 		 324 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1361  hypothetical protein  78.3 
 
 		 320 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00507818  normal  0.397175 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1686  hypothetical protein  73.42 
 
 		 328 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.658717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3352  membrane protein  47.71 
 
 		 311 aa  252  6e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  45.72 
 
 		 305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3975  hypothetical protein  45.13 
 
 		 312 aa  239  5.999999999999999e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.56 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000192809  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.44 
 
 		 306 aa  233  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00208172  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3755  hypothetical protein  44.71 
 
 		 328 aa  231  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000395481  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3610  integral membrane protein  44.71 
 
 		 328 aa  231  9e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000195591  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3976  hypothetical protein  44.71 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000242668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0795  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.19 
 
 		 320 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0560  hypothetical protein  43.19 
 
 		 320 aa  229  7e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00477006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3480  putative transporter  41.94 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000496501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0516  hypothetical protein  41.94 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000278585  hitchhiker  0.00919443 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03000  hypothetical protein  41.94 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00567967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3669  putative transporter  41.94 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000521429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3377  putative transporter  41.94 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.82024e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.94 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000715039  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03049  conserved inner membrane protein  41.94 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00601022  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3492  putative transporter  41.61 
 
 		 321 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3494  putative transporter  41.61 
 
 		 321 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00919199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3599  putative transporter  41.61 
 
 		 321 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0879234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3563  putative transporter  41.61 
 
 		 321 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3620  hypothetical protein  42.16 
 
 		 321 aa  222  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000693359  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3586  putative transporter  41.61 
 
 		 321 aa  222  8e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000241  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0475  hypothetical protein  41.8 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4506  putative transporter  41.94 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000436684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0247  hypothetical protein  38.93 
 
 		 306 aa  203  4e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00278162  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4064  hypothetical protein  33.97 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3601  hypothetical protein  33.65 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3427  hypothetical protein  33.65 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0525  hypothetical protein  33.33 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4040  integral membrane domain-containing protein  33.65 
 
 		 349 aa  146  5e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0579  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.95 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3761  hypothetical protein  31.83 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0573  hypothetical protein  31.83 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0634  hypothetical protein  31.83 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0549  hypothetical protein  31.61 
 
 		 324 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0498  integral membrane domain-containing protein  34.11 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0565  hypothetical protein  30.23 
 
 		 325 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0631  hypothetical protein  30.56 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.789426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3715  hypothetical protein  31.72 
 
 		 322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  26.47 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.7 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24.3 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.92 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.09 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  25.56 
 
 		 312 aa  50.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  24.51 
 
 		 311 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  27.46 
 
 		 286 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.02 
 
 		 315 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  30.72 
 
 		 294 aa  49.3  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  24.92 
 
 		 303 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.18 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  30.29 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  26.1 
 
 		 303 aa  47.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  20.96 
 
 		 317 aa  47  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.63 
 
 		 311 aa  46.2  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  22 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  24.9 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  22.39 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  26.37 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  26.38 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0354  hypothetical protein  25.56 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  27.96 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 		 286 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  26.7 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.71 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  22.81 
 
 		 327 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.47 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  26.21 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  28.98 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  27.41 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.16 
 
 		 304 aa  43.1  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  27.27 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  28.57 
 
 		 286 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.36 
 
 		 305 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  22.08 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  28.57 
 
 		 296 aa  42.7  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  28.57 
 
 		 296 aa  42.7  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>