94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4094 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4094  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  620  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1729  hypothetical protein  79.11 
 
 		 320 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3663  hypothetical protein  78.16 
 
 		 319 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1753  hypothetical protein  76.83 
 
 		 324 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3961  hypothetical protein  76.83 
 
 		 324 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.761458  normal  0.0378456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1345  hypothetical protein  75.95 
 
 		 320 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0815858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1686  hypothetical protein  71.52 
 
 		 328 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.658717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1361  hypothetical protein  77.53 
 
 		 320 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00507818  normal  0.397175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3352  membrane protein  47.88 
 
 		 311 aa  245  9e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3975  hypothetical protein  44.41 
 
 		 312 aa  238  9e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  44.74 
 
 		 305 aa  238  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3755  hypothetical protein  43.2 
 
 		 328 aa  225  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000395481  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3610  integral membrane protein  43.2 
 
 		 328 aa  225  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000195591  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.16 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000192809  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3976  hypothetical protein  43.2 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000242668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0795  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.86 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.76 
 
 		 306 aa  222  6e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00208172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0560  hypothetical protein  41.75 
 
 		 320 aa  222  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00477006  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3480  putative transporter  40.79 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000496501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0516  hypothetical protein  40.79 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000278585  hitchhiker  0.00919443 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03000  hypothetical protein  40.79 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00567967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3669  putative transporter  40.79 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000521429  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3377  putative transporter  40.79 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.82024e-19  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.79 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000715039  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03049  conserved inner membrane protein  40.79 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00601022  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3494  putative transporter  39.67 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00919199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3599  putative transporter  39.67 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0879234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3563  putative transporter  39.67 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3492  putative transporter  39.67 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543428  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3586  putative transporter  40.46 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000241  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3620  hypothetical protein  39.35 
 
 		 321 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000693359  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0475  hypothetical protein  40.51 
 
 		 334 aa  205  8e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4506  putative transporter  40.79 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000436684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0247  hypothetical protein  38.59 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00278162  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4064  hypothetical protein  32.09 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4040  integral membrane domain-containing protein  34.58 
 
 		 349 aa  149  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0579  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.56 
 
 		 324 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0525  hypothetical protein  33.9 
 
 		 329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0573  hypothetical protein  33.67 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3761  hypothetical protein  33.67 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0549  hypothetical protein  33.22 
 
 		 324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3601  hypothetical protein  33.44 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3427  hypothetical protein  33.44 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0631  hypothetical protein  34.82 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.789426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0498  integral membrane domain-containing protein  34.29 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0634  hypothetical protein  32.89 
 
 		 339 aa  139  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3715  hypothetical protein  34.62 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0565  hypothetical protein  34.84 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  27.24 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  25.9 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  27.24 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  27.4 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  29.43 
 
 		 294 aa  57  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.78 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  27.71 
 
 		 312 aa  52.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  25.6 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2782  hypothetical protein  28.71 
 
 		 286 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0548906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3033  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 		 286 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0835297  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  22.02 
 
 		 294 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4320  hypothetical protein  25.73 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.22 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.11 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1183  DMT superfamily efflux pump, RarD  28.68 
 
 		 319 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.297092 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  29.8 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  26.8 
 
 		 328 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  21.56 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23 
 
 		 293 aa  47  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0149413 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  24.11 
 
 		 308 aa  46.2  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.71 
 
 		 309 aa  45.8  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.13 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  25.86 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  28.9 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  29.69 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  22.99 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  22.61 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  31.46 
 
 		 317 aa  43.9  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2478  hypothetical protein  26.2 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.57 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3051  hypothetical protein  29.63 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.943556  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0310  integral membrane protein  28.42 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.12 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  27.61 
 
 		 314 aa  43.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 		 289 aa  43.5  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  24.8 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  26.13 
 
 		 299 aa  43.1  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  24.76 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  24.09 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  22.55 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1207  rarD protein  28.15 
 
 		 319 aa  43.1  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  22.22 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.22 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  22.22 
 
 		 303 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.35 
 
 		 286 aa  42.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>