134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3976 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3976  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  619  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000242668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3610  integral membrane protein  100 
 
 		 328 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000195591  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3755  hypothetical protein  100 
 
 		 328 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000395481  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0475  hypothetical protein  83.28 
 
 		 334 aa  517  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000164528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0560  hypothetical protein  79.1 
 
 		 320 aa  491  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00477006  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0795  protein of unknown function DUF6 transmembrane  78.46 
 
 		 320 aa  490  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3563  putative transporter  80.53 
 
 		 321 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0151883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3599  putative transporter  80.53 
 
 		 321 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0879234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3494  putative transporter  80.53 
 
 		 321 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00919199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3492  putative transporter  80.53 
 
 		 321 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000543428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03049  conserved inner membrane protein  79.54 
 
 		 321 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00601022  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  79.54 
 
 		 321 aa  475  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000715039  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3620  hypothetical protein  78.36 
 
 		 321 aa  474  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000693359  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03000  hypothetical protein  79.54 
 
 		 321 aa  475  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00567967  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3377  putative transporter  79.54 
 
 		 321 aa  475  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.82024e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3669  putative transporter  79.54 
 
 		 321 aa  475  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000521429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0516  hypothetical protein  79.54 
 
 		 321 aa  475  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000278585  hitchhiker  0.00919443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3480  putative transporter  79.54 
 
 		 321 aa  475  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000496501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3586  putative transporter  78.88 
 
 		 321 aa  472  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000241  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  72.82 
 
 		 314 aa  456  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000192809  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4506  putative transporter  78.88 
 
 		 321 aa  454  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000436684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  73.75 
 
 		 306 aa  428  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00208172  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0247  hypothetical protein  45.1 
 
 		 306 aa  258  8e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00278162  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4094  hypothetical protein  43.2 
 
 		 319 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3663  hypothetical protein  44.68 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1729  hypothetical protein  43.62 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.35536  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1686  hypothetical protein  44.75 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.658717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1753  hypothetical protein  42.04 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3961  hypothetical protein  41.72 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.761458  normal  0.0378456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1345  hypothetical protein  42.52 
 
 		 320 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0815858  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3352  membrane protein  38.85 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1361  hypothetical protein  42.23 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00507818  normal  0.397175 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  38.06 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3975  hypothetical protein  37.29 
 
 		 312 aa  187  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3427  hypothetical protein  31.83 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3601  hypothetical protein  31.83 
 
 		 329 aa  154  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0525  hypothetical protein  31.51 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4040  integral membrane domain-containing protein  31.73 
 
 		 349 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0579  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.56 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3761  hypothetical protein  31.44 
 
 		 324 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0549  hypothetical protein  31.65 
 
 		 324 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0573  hypothetical protein  31.44 
 
 		 324 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.162626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4064  hypothetical protein  31.91 
 
 		 321 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0634  hypothetical protein  30.64 
 
 		 339 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0565  hypothetical protein  31.72 
 
 		 325 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0631  hypothetical protein  31.38 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.789426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3715  hypothetical protein  28.04 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0498  integral membrane domain-containing protein  30.85 
 
 		 316 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.74 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0857  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.74 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  4.28203e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.92 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.07 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  31.44 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  24.48 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  23.96 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  24.63 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  24.86 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  27.88 
 
 		 300 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  29.23 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  24.29 
 
 		 298 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  32.83 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  24.25 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  25 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  24.44 
 
 		 308 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.59 
 
 		 315 aa  52.8  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02670  predicted permease, DMT superfamily  25 
 
 		 319 aa  52.8  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  23.88 
 
 		 309 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4168  permeases of the drug/metabolite transporter (DMT)  24.81 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  27.69 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  23.56 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  23.04 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1079  hypothetical protein  27.4 
 
 		 323 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.901985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  22.06 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  23.88 
 
 		 305 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  27.5 
 
 		 296 aa  49.3  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  21.99 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  21.99 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3054  putative transmembrane protein  29.38 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.368315  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  21.99 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3075  EamA family protein  21.99 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0919  hypothetical protein  25.76 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0499  hypothetical protein  29.5 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  27.69 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  28.06 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.45 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1865  hypothetical protein  24.14 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.38 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1660  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.11 
 
 		 320 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.03 
 
 		 306 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 		 310 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.78 
 
 		 320 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  23.27 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  31.89 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  32.45 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0144  hypothetical protein  22.22 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  27.69 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.71 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  28.46 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.44 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  29.44 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>