35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1604 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1604  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  597  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0432  hypothetical protein  27.31 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  29.86 
 
 		 303 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  29.86 
 
 		 303 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0433  hypothetical protein  26.47 
 
 		 303 aa  52.4  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  28.44 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  29.86 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0610  hypothetical protein  25 
 
 		 349 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00052369  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  29.86 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  29.38 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  29.38 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  25.29 
 
 		 312 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  25.96 
 
 		 324 aa  49.7  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  27.96 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  26.21 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  28.91 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  28.91 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  28.91 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2584  hypothetical protein  25.2 
 
 		 298 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0865968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  23.7 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  25 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1103  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.72 
 
 		 352 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.24 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  23.84 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  24.71 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  26.67 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  24.12 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4978  hypothetical protein  26.92 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1120  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.21 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.575682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.49 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  26.04 
 
 		 283 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  30.49 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0138  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.99 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.12 
 
 		 312 aa  43.5  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4731  hypothetical protein  24.29 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404903 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>