38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2320 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2320  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  279  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.384685  normal  0.0277976 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  36.3 
 
 
146 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  35 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0880  hypothetical protein  37.4 
 
 
126 aa  88.2  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3380  hypothetical protein  37.4 
 
 
126 aa  87.8  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2414  hypothetical protein  36.8 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000101456  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2961  hypothetical protein  34.71 
 
 
126 aa  84  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1152  hypothetical protein  36.36 
 
 
126 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3124  hypothetical protein  37.39 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0351825  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4991  hypothetical protein  43 
 
 
267 aa  77  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.788472  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2135  hypothetical protein  37.08 
 
 
260 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.681933 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  37.25 
 
 
249 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  37.25 
 
 
249 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2134  hypothetical protein  31.06 
 
 
284 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.546995 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3125  hypothetical protein  34.07 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.130009  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  31.13 
 
 
118 aa  61.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  34.23 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  28.8 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  33.87 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  29.77 
 
 
159 aa  53.9  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  29.77 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2476  transporter  31.13 
 
 
117 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000067585  decreased coverage  0.00107573 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2747  hypothetical protein  33.61 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000323664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3364  hypothetical protein  33.61 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  29.91 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2477  hypothetical protein  28.3 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373753 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0093  conserved hypothetical protein; inner membrane protein  29.66 
 
 
112 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2922  hypothetical protein  29.69 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2321  hypothetical protein  29.7 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1879  hypothetical protein  36.05 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1892  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.156341  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1266  hypothetical protein  34.88 
 
 
141 aa  44.3  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1304  hypothetical protein  34.88 
 
 
142 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4487  hypothetical protein  38.1 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  28.7 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  25.62 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  29.9 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  25.49 
 
 
122 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.550209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>