19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2321 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2321  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  249  9.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  37.07 
 
 
249 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  37.07 
 
 
249 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4991  hypothetical protein  36.21 
 
 
267 aa  77  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.788472  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3124  hypothetical protein  35.9 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0351825  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2414  hypothetical protein  36.04 
 
 
126 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000101456  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2961  hypothetical protein  35.14 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116346  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  35.71 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0880  hypothetical protein  36.94 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3380  hypothetical protein  36.94 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1152  hypothetical protein  36.04 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  35.14 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2134  hypothetical protein  36.19 
 
 
284 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.546995 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2135  hypothetical protein  33.65 
 
 
260 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.681933 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2320  hypothetical protein  30.17 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.384685  normal  0.0277976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  28.97 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  28.04 
 
 
125 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3125  hypothetical protein  44.23 
 
 
135 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.130009  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1038  hypothetical protein  30.7 
 
 
122 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.550209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>