29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3124 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3124  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  234  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0351825  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3092  protein of unknown function DUF6, transmembrane  42.37 
 
 
147 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0387826  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1152  hypothetical protein  41.03 
 
 
126 aa  98.2  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2827  hypothetical protein  38.98 
 
 
146 aa  96.7  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0460127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2961  hypothetical protein  42.74 
 
 
126 aa  96.7  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116346  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2811  hypothetical protein  40.35 
 
 
249 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.949614  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3305  hypothetical protein  40.35 
 
 
249 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2414  hypothetical protein  41.03 
 
 
126 aa  94.4  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000101456  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4991  hypothetical protein  44.44 
 
 
267 aa  92.8  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.788472  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2134  hypothetical protein  45.83 
 
 
284 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.546995 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0880  hypothetical protein  38.14 
 
 
126 aa  89.4  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3380  hypothetical protein  37.29 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2135  hypothetical protein  41.84 
 
 
260 aa  87.8  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.681933 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2320  hypothetical protein  37.39 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.384685  normal  0.0277976 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3972  hypothetical protein  37.82 
 
 
125 aa  67  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0829336  normal  0.0274812 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2321  hypothetical protein  35.29 
 
 
126 aa  67  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1132  hypothetical protein  36.67 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2966  hypothetical protein  31.3 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0853  hypothetical protein  31.58 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0100048  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0801  hypothetical protein  31.58 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.351912  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3125  hypothetical protein  35.77 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.130009  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3729  transporter protein  30.7 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000221526  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0826  hypothetical protein  30.83 
 
 
150 aa  52  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4588  small multidrug resistance transmembrane protein  32.73 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.190224  hitchhiker  0.0040913 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2116  putative small multidrug resistance transmembrane protein  28.43 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.380203  normal  0.497912 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1104  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.62 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0955  hypothetical protein  37.31 
 
 
115 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00515656  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3408  hypothetical protein  25.25 
 
 
121 aa  40  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0526043  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1542  hypothetical protein  40.3 
 
 
303 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0507493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>